Resumen de Trazabilidad genética en ganado bovino: estudio comparativo de la eficacia de microsatélites y snps
RESUMEN La crisis de confianza de los consumidores desatada en los últimos años por la aparición de distintas enfermedades transmisibles al hombre como la Encefalopatía Espongiforme Bovina (EEB), ha supuesto una creciente sensibilización de todos los sectores en los temas relacionados con la seguridad alimentaria. En este sentido la trazabilidad se ha convertido en una herramienta fundamental al servicio de la calidad alimentaria.
En la presente memoria se propone el establecimiento de un sistema de trazabilidad genética basado en marcadores de ADN. Se ha realizado un estudio comparativo de la eficiencia entre microsatélites y SNPs.
En el estudio se han utilizado un total de 675 muestras de animales procedentes de dos razas bovinas del norte de Aragón: Parda de Montaña y Pirenaica. El muestreo se llevó a cabo en el período comprendido entre el año 2004 y 2005; en una primera fase se tomaron muestras de sangre de los reproductores y descendientes, y posteriormente se tomaron muestras de carne de animales descendientes que fueron sacrificados en matadero. Toda la información obtenida se ha almacenado en una base de datos que permite, conjuntamente con un programa diseñado, gestionar y verificar el sistema de trazabilidad.
Se han estimado las frecuencias alélicas de un gran número de SNPs en diferentes razas españolas, eligiéndose para el estudio aquellos SNPs que presentaban frecuencias intermedias.
Los marcadores de ADN utilizados han demostrado su utilidad en identificación, paternidad y trazabilidad con poderes de exclusión superiores al 99% para microsatélites y superiores al 96% para SNPs. De igual modo se han obtenido valores de probabilidades de identidad del orden de 10-9 para microsatélites y de 10-7 para SNPs, por lo que las probabilidades de encontrar individuos al azar que compartan los mismos genotipos son 1:100 millones para microsatélites y 1:1 millón para SNPs. Además, y como método complementario de trazabilidad ha sido demostrada la aplicabilidad de estos paneles en la asignación de individuos a raza o población.
Diferentes parámetros genéticos (probabilidad de identidad y heterocigosidad) han sido calculados tanto en progenitores como en descendientes. Se ha detectado una clara correlación entre las variables de ambos grupos de animales y mediante un análisis de regresión se han obtenido una serie de modelos matemáticos que permiten predecir con una elevada fiabilidad el comportamiento de las variables en los descendientes a partir de la información de los progenitores.
En relación a los SNPs incluidos en el panel utilizado en el presente trabajo, se ha demostrado que el SNP g.329C>T (AJ496781) ubicado en el cromosoma 26, se encuentra en una región duplicada, hecho que podría justificar las frecuencias intermedias detectadas por otros autores. Se recomienda la exclusión de este marcador o, cualquier otro con similares características, de cualquier panel de marcadores genéticos destinado a estudios de identificación, trazabilidad y asociación a determinadas patologías tanto en las especies animales como en la especie humana.
Los paneles de SNPs presentan una ventaja frente a los microsatélites ya que pueden incluirse SNPs de regiones codificantes que sirvan simultáneamente para identificación genética y para establecer posibles asociaciones con caracteres productivos. En el presente estudio se ha analizado el SNP c.1455A>G (U02564) del exón 12 de la transferrina bovina que supone un cambio aminoacídico Asp/Gly, que nos ha permitido asociar el gen de la transferrina a cantidad de grasa en la leche.
