Recombinación genética en vih-1: inducción de formas genéticas in vitro y su comparación con las originadas in vivo

• Autores: Mercedes Muñoz Nieto-Sandoval
• Directores de la Tesis: Rafael Nájera Morrondo (dir. tes.), Lucía Pérez Alvarez (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidad Complutense de Madrid ( España ) en 2008
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: José Prieto Prieto (presid.), María Luisa Gómez-Lus Centelles (secret.), Ascensión Bernal Zamora (voc.), Carlos J. Domingo Fernandez (voc.), Esteban Domingo Solans (voc.)
• Materias:
  • Ciencias de la vida
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• Resumen

  • Hasta el momento actual se han identificado 54 formas genéticas de VIH-1, incluyendo 9 subtipos y sub-subtipos, 43 Formas Recombinantes Circulantes y múltiples Formas Recombinantes Únicas, lo que apoya la importancia de las infecciones dobles y que la recombinación es el principal mecanismo de variación del VIH-1. En esta tesis doctoral se planteó que las formas recombinantes pueden tener propiedades biológicas diferentes a sus virus parentales, demostrando la detección temprana de cepas IS/X4 o IS/X4R5 en pacientes infectados por CRF14_BG, sugiriendo una progresión más rápida de la enfermedad, frente a cepas NIS/R5 en los pacientes infectados por subtipo G, incluso en estadíos avanzados de la enfermedad, lo que favorecería la transmisión y difusión de esta forma genética. Se planteó además el estudio y seguimiento de infecciones dobles por subtipo B y G con el fin de investigar la compartimentación de las poblaciones recombinantes generadas. La obtención de 6 aislados primarios y d e 17 secuencias del genoma completo del VIH-1 de diferentes compartimentos, permitió definir la compartimentación de formas recombinantes BG, definir los diferentes puntos de recombinación existentes en las mismas y su papel en aspectos como son las caracterización biológica o la presencia de mutaciones de resistencia. La presencia de un patrón de recombinación en los genes gag, pol y nef, idéntico durante 5 años de seguimiento y en diferentes compartimentos, nos hizo plantearnos la existencia d e determinadas posiciones en el genoma del VIH-1 que facilitan la persistencia de patrones de recombinación. Con el fin de demostrar si existen regiones del genoma con mayor tendencia a la recombinación se generaron 7 recombinantes in vitro y se compararon con los seleccionados in vivo. La obtención y análisis de 71 clones moleculares de dos fragmentos diferentes del genoma afianzan la idea de que en el gen pol, con mayor homología de su secuencia, se produce con mayor frecuencia el fenómeno de la recombinación.