RESUMEN: Streptococcus pneumoniae es uno de los principales patógenos humanos.
En niños es el principal responsable de otitis media y uno de los más importantes causantes de meningitis y neumonía. En adultos es el principal agente etiológico de la neumonía adquirida en la comunidad, asi como de sinusitis, meningitis y bacteriemia. Su nicho ecológico lo constituye el tracto respiratorio del ser humano y, por tanto se considera que cualquier individuo ha estado colonizado en algún momento de su vida. Streptococcus mitis es una especie con la que comparte su hábitat natural y que se encuentra muy próxima desde el punto de vista taxonómico. Una correcta identificación entre ellas es fundamental puesto que, determinar si un aislado es neumococo u otra especie del grupo mitis, condiciona el tratamiento a prescribir.
La mayoría de los aislados clínicos de S. pneumoniae son lisogénicos lo que significa que portan fagos insertados en su genoma. La presencia de estos profagos podría estar contribuyendo de forma relevante a la virulencia de estos importantes patógenos humanos.
En el trabajo desarrollado en esta Tesis se ha realizado la secuenciación completa del profago EJ-1 (perteneciente a la familia Myoviridae) aislado de una cepa clínica que, inicialmente, fue identificada como un neumococo atípico y que, finalmente, ha sido asignada a la especie S. mitis. EJ-1 es el primer fago de la familia Myoviridae que infecta a bacterias con bajo contenido en G+C que ha sido secuenciado en su totalidad. El estudio detallado de su genoma ha puesto de manifiesto una organización génica en mosaico ya que sólo los genes que codifican las proteínas responsables de la cola muestran un parecido significativo con homológos en fagos Myoviridae mientras que el resto de orf presentan semejanza con genes de fagos Siphoviridae.
Además del profago EJ-1, en esta Tesis se han estudiado dos nuevas cepas lisógenas de S. mitis. Las cepas 8
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