El objetivo principal de este trabajo ha sido conocer y describir este sistema acuático, caracterizando el medio a través del análisis detallado de los factores que influyen en el estado de la laguna durante varios ciclos hidrológicos muy direntes entre sí. Además, se ha estudiado la comunidad planctónica bajo dos líneas direrentes, una clásica (análisis de la composición taxonómica del fitoplancton y del zooplancton), y otra innovadora en limnología como es la creación de espectros de tamaño mediante citometría de flujo, microscopía de epifluorescencia y análisis de imagen.
El estudio del comportameinto de la laguna Honda durante dos ciclos hidlógicos )1994-95 y 1998-99) ha permitido observar la variabilidad de este sistema acuático. Del análsisid e las variables fisico-químicas se observa que este ecosistema pasa de un estado "hipersalino" durante todo el primer ciclo hasta llegar a ser "meso-hiposalino" Esta misma variabilidad es igualmente bien patente en la clasificación del estado trófico de la laguna, comportándose en el primer ciclo hidrólogico como hipereutrófico y como un sistema ultraoligotrófico durante el segundo ciclo. Si se comparan las comunidades halladas en la laguna Honda, se observa una composición taxonómica totalmente diferente, que lleva a clasificar el primer periodo con una comunidad gamma y delta hipersalina, con un dominio del fitoplancton, y al segundo ciclo con una comunidad alfa y beta hipersalina, caracteriazda por el zooplancton.
Los resultados derivados de los espectros de tamaño ratifican que la escla primaria o fisiológica es un carácter general para los diferentes sistemas acuáticos. El examen de la estructura secundaria pone de manifiesto las diferencias entre ecosistemas donde durante el cilco hidrólógico 1994-95 muestra una tendencia a tamaños menores del fitoplancton y durante els egundo ciclo 1998-99 se observa un espectro de tamaños del zooplancton más amplio y con más importancia de
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