Espectro de sobrecrecimientos asociados a PIK3CA: expansión de fenotipo y genotipo, y desarrollo de un protocolo diagnóstico

• Autores: Gema Gordo Trujillo
• Directores de la Tesis: Víctor Manuel Martínez González (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidad Autónoma de Madrid ( España ) en 2018
• Idioma: español
• Número de páginas: 189
• Tribunal Calificador de la Tesis: José Fernández Piqueras (presid.), José Luis Bella Sombría (secret.), Feliciano Jesús Ramos Fuentes (voc.), Pierre Vabres (voc.), Enrique Galán Gómez (voc.)
• Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Biociencias Moleculares por la Universidad Autónoma de Madrid
• Materias:
  • Ciencias de la vida
    • Genética
    • Biología vegetal (botánica)
  • Ciencias médicas
    • Ciencias clínicas
      • Genética clínica
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en: Biblos-e Archivo
• Resumen

  • El sobrecrecimiento segmentario y las malformaciones vasculares son dos características clínicas prevalentes en los síndromes causados por mutaciones germinales y/o somáticas en diferentes genes de la ruta PI3K/AKT/mTOR: Megalencefalia-polimicrogiria-polidactilia-hidrocefalia (AKT3 y PIK3R2), Espectro de Sobrecrecimientos Asociados a PIK3CA (PROS; PIK3CA) o síndrome de Smith-Kingsmore (mTOR), entre otros. En el caso de PROS, debido a que las mutaciones en PIK3CA ocurren como un evento post-cigótico, causando mosaicismo somático, el espectro fenotípico dentro de este grupo varía ampliamente en severidad y localización dependiendo del tipo celular afectado y del tiempo durante el desarrollo embrionario en el que surgió la mutación. Las características clínicas no siempre son constantes entre los diferentes síndromes incluidos en PROS, existiendo además un gran solapamiento fenotípico, dificultando el diagnóstico clínico y molecular.

    En esta Tesis Doctoral se estudió clínica y molecularmente una cohorte de 96 pacientes con características clínicas compatibles con el espectro PROS, incluyendo pacientes con diagnóstico de Macrocefalia-Malformación Capilar, síndrome CLOVES, macrodactilia y otros con fenotipo difuso, así como una serie de pacientes con DCMO, una entidad clínica, de causa desconocida y con características similares al espectro PROS. El objetivo fue ampliar el fenotipo y el genotipo del espectro PROS, y establecer un protocolo que permita un mejor diagnóstico clínico y molecular de los pacientes y una mejor comprensión de las patologías incluidas en el espectro. Para ello se utilizaron tres paneles de genes diferentes de secuenciación masiva (NGS) para analizar el ADN extraído de muestras de linfocitos de sangre periférica, saliva y/o tejido afectado de 85 de estos pacientes. Las variantes candidatas se validaron utilizando tres metodologías alternativas y se realizaron estudios funcionales en variantes no identificadas previamente. Se detectaron 23 variantes diferentes en PIK3CA en pacientes con PROS. Además de en este gen, se detectaron variantes en otros tres genes incluidos en la ruta PI3K/AKT/mTOR en seis pacientes, cuatro de ellos con variantes en mTOR (tres en línea germinal y uno en mosaico somático), un paciente con una variante en mosaico en AKT3 y el último con una variante en PTEN. Asimismo, se identificó al primer caso de DCMO con una variante probablemente patogénica en PIK3CA.

    La combinación de los estudios clínicos y moleculares presentados en esta Tesis Doctoral amplía el conocimiento fenotípico y genotípico del espectro PROS, y establece un protocolo experimental y bioinformático para el diagnóstico de estos pacientes mediante el uso de NGS con grandes profundidades de lecturas.