A Systems-level study of giant regulation in Drosophila melanogaster
- Autores: Astrid Hoermann
- Directores de la Tesis: Johannes Jaeger (dir. tes.)
- Lectura: En la Universitat Pompeu Fabra ( España ) en 2014
- Idioma: español
- Tribunal Calificador de la Tesis: Alexander Stark (presid.), Berta Alsina i Español (secret.), James Sharpe (voc.)
- Materias:
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- Tesis en acceso abierto en: TDX
- Resumen
Esta tesis revela la regulación transcripcional del gen gap giant (gt) en el embrión blastodermal de Drosophila por ingeniería inversa: un modelo matemático infiere los mecanismos subyacentes de datos cuantitativos de expresión recopilados en un fondo genético silvestre. El modelo se amolda a mRNA reportero controlado por elementos reguladores en cis (CRE) de gt. Es una herramienta potente para investigar cómo se forma el patrón a nivel molecular por los sitios de unión de factores de transcripción y permite predecir la expresión en cepas mutantes.
Para este fin, he creado líneas de Drosophila conteniendo los CRE posteriores gt-1 o gt-3 y he coleccionado datos de expresión mediante in situ hibridación fluorescente con alta resolución espacio-temporal, considerando 10 puntos de tiempo del desarrollo del embrión. El modelo es capaz de ajustarse al padrón observado y sugiere contribuciones plausibles de los activadores y represores. La presente tesis esclarece la regulación diferencial de estos dos CRE adyacentes de gt y presenta la primera evidencia experimental de auto-activación de gt mediante mutagénesis de sus sitios de unión en sus elementos reguladores.
Tras la optimización de los parámetros en un fondo de tipo silvestre, el modelo predice correctamente los cambios observados en mutantes de Krüppel y tailless. Otras contribuciones reglamentarias sugeridas por el modelo son confirmadas por evaluación sistemática de los CREs en mutantes de knirps y de hunchback (hb) maternal, hb zigoto y hb maternal & zigoto.
