Big complexity in a minimal bacterium

• Autores: Marc Guell Cargol
• Directores de la Tesis: Luis Serrano Pubull (dir. tes.)
• Lectura: En la Universitat Pompeu Fabra ( España ) en 2010
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Lauro Sumoy Van Dyck (presid.), Juan Antonio Gabaldón Estevan (secret.), Robert Castelo Valdueza (voc.), Jaume Piñol Ribas (voc.), Heinz Himmelbauer (voc.)
• Materias:
  • Ciencias de la vida
    • Microbiología
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en:  TDX  TDX 
• Resumen

  • Con sólo 689 genes Mycoplasma pneumoniae se encuentra entre los organismos más simples que se conocen. Debido a esta simplicidad, Mycoplasma representa un organismo atractivo para llevar a cabo estudios a nivel genómico. Se espera de estos trabajos que pretenden describir de forma cuantitativa el organismo entero que ayuden a entender los principios básicos de la vida.

    Para el estudiar con profundidad del transcriptoma, se ha hecho uso de una combinación de datos de "tiling arrays" con especificidad de hebra, ultraseqüenciación y más de 252 microarrays. Tras analizar los resultados se ha detectado una alta presencia de transcritos alternativos (42%) dentro de operones y un alto contenido de ARN de tipo "antisense" (89).

    También se ha realizado un estudio detallado del metabolismo. Se ha revisado y completado manualmente el mapa metabólico de M. pneumoniae, lo que ha permitido el diseño de un medio mínimo con el uso de 19 ingredientes esenciales. El mapa se ha completado con diferentes medidas de indicadores de biomasa, metabolitos y flujos. También se ha estudiado la regulación de metabolismo mediante microarrays.

    Por otra parte, se han medido sistemáticamente las interacciones proteína-proteína mediante "Tandem affinity purification-mass spectrometry (TAP-MS)". Este análisis ha detectado 178 complejos proteicos diferentes, los cuales han sido complementados con modelos estructurales, microscopía electrónica y tomografía electrónica.

    Mediante la integración de estos datos, se puede mostrar que este pequeño bacteria esconde un inesperada complejidad con características como la frecuencia de transcritos alternativos y ARN "antisense", una red metabólica pequeña pero fuertemente controlada y una alta organización del proteoma .