Scipion: a software framework toward integration, reproducibility and validation in 3d electron microscopy

• Autores: Miguel de la Rosa
• Directores de la Tesis: Roberto Marabini Ruiz (dir. tes.), José María Carazo García (codir. tes.)
• Lectura: En la Universidad Autónoma de Madrid ( España ) en 2017
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Erik Lindahl (presid.), Xavier Alamán Roldán (secret.), Jaime Martín-Benito Romero (voc.)
• Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Ingeniería Informática y de Telecomunicación por la Universidad Autónoma de Madrid
• Materias:
  • Ciencias tecnológicas
    • Tecnología de las telecomunicaciones
• Enlaces
  • Tesis en acceso abierto en: Biblos-e Archivo
• Resumen

  • En los últimos años, la microscopía electrónica tridimensional (3DEM) ha experimentado una gran revolución tanto instrumentamental como metodológica. Uno de los factores principales de dicha revolución es el desarrollo del software de procesamiento de imágenes. En esta tesis presentamos Scipion, una plataforma que integra los distintos paquetes de procesamiento de image en 3DEM. Scipion permite la ejecución de protocolos de procesamiento de imágenes de una forma reusable, estandarizada y reproducible. Estos protocolos incorporan herramientas de distintos paquetes y garantizan total interoperabilidad entre las mismas. Scipion es un proyecto de código abierto que puede ser descargado desde http://scipion.cnb.csic.es.