Análisis del perfil de microRNA en la eliminación de los progenitores esqueléticos de los espacios interdigitales embrionarios
- Autores: Beatriz García-Riart Monzón
- Directores de la Tesis: Juan Mario Hurlé González (dir. tes.), Juan Antonio Montero Simón (dir. tes.)
- Lectura: En la Universidad de Cantabria ( España ) en 2017
- Idioma: español
- Número de páginas: 166
- Tribunal Calificador de la Tesis: Juan A. García-Porrero (presid.), Virginio Enrique García Martínez (secret.), Javier García Sancho (voc.)
- Programa de doctorado: Programa de Doctorado en Biología Molecular y Biomedicina por la Universidad de Cantabria
- Materias:
- Enlaces
- Tesis en acceso abierto en: UCrea
- Resumen
- español
La secuenciación masiva de RNA de pequeño tamaño, en combinación con diversos análisis por qPCR, pusieron de manifiesto la implicación de los microRNA en la regulación de los eventos que conducen a la regresión del tejido presente en el espacio interdigital, en los autopodios de los embriones de pollo.
Los microRNA fueron originalmente descubiertos en Caenorhabditis elegans, estos se encuentran presentes en la mayoría de los eucariotas, incluidos los seres humanos; Los microRNA son moléculas de ARN no codificantes y altamente conservadas entre especies. Están implicados en la regulación de la expresión génica. Se estima que los microRNA suponen entre el 1-5% del genoma humano y pueden llegar a regular al menos el 30% de los genes. los microRNA maduroS se generan a partir del procesamiento, en dos etapas, del microRNA primario (pri-miRNA), que se incorpora al complejo inductor de silenciamiento (RISC). Los microRNA maduros reconocen sus mRNA para la represión de su traducción y regular así negativamente la expresión génica.
Durante el periodo de remodelación tisular se detectaron, en el tejido presente en el espacio interdigital, a partir de la secuenciación masiva, un total de 612 secuencias de microRNA de pollo (gga-miRNAs) ya conocidos, y 401 secuencias no identificadas. Treinta y seis microRNA, representados por más de 750 lecturas por millón, mostraron expresión diferencial entre las etapas 29HH (6 id periodo ) y 32HH (7,5 id ), que corresponden al inicio y al pico de la muerte celular interdigital. Veinte microRNA aumentaron su nivel de expresión por lo menos 1,5 veces, y 16 disminuyeron su nivel de expresión por lo menos 0,5 veces. Entre los microRNA que aumentaron su nivel de expresión encontramos microARN con reconocidas funciones proapoptóticas en otros sistemas (miR-181 familia, miR-451 y miR-148a), microRNA asociados a nflamación y a senescencia celular (miR-21 y miR-146) y microRNA capaces de inducir cambios en el Matriz extracelular (miR-30c). En contraste, los microRNA con efectos antiapoptóticos demostrados en otros sistemas, como miR-222 y miR-205, disminuían su nivel de expresión. Además, miR-92, un importante regulador positivo de la proliferación celular, también disminuyó su nivel de expresión. En conjunto, estos hallazgos indican un papel positivo de los miARN en el control de la regresión tisular y la muerte celular durante el proceso de regresión tisular que se produce en el espacio interdigital, uno de los ejemplos más característicos de muerte celular programada que se produce durante la etapa embrionaria.
- English
Next-generation sequencing in combination with quantitative polymerase chain reaction analysis revealed a dynamic miRNA signature in the interdigital mesoderm of the chick embryonic limb in the course of interdigit remodelling.
MicroRNAs originally discovered in Caenorhabditis elegans, is found in most eukaryotes, including humans; MicroRNA are small, highly conserved non-coding RNA molecules involved in the regulation of gene expression, It is predicted that miRNA account for 1-5% of the human genome and regulate at least 30% of protein-coding genes. Mature miRNA is generated through two-step cleavage of primary miRNA (pri-miRNA), which incorporates into the effector complex RNA-induced silencing complex (RISC). The miRNA functions as a guide by base-pairing with target mRNA to negatively regulate its expression. The level of complementarity between the guide and mRNA target determines which silencing mechanism will be employed; cleavage of target messenger RNA (mRNA) with subsequent degradation or translation inhibition.
During this period, 612 previously known chicken miRNAs (gga-miRNAs) and 401 nonidentified sequences were expressed in the interdigital mesoderm. Thirty-six microRNAs, represented by more than 750 reads per million, displayed differential expression between stages HH29 (6 id) and HH32 (7.5 id), which correspond to the onset and the peak of interdigital cell death. Twenty miRNAs were upregulated by at least 1.5-fold, and sixteen were downregulated by at least 0.5-fold. Upregulated miRNAs included miRNAs with recognized proapoptotic functions in other systems (miR-181 family, miR-451 and miR-148a), miRNAs associated with inflammation and cell senescence (miR-21 and miR-146) and miRNAs able to induce changes in the extracellular matrix (miR-30c). In contrast, miRNAs with known antiapoptotic effects in other systems, such as miR-222 and miR-205, became downregulated. In addition, miR-92, an important positive regulator of cell proliferation, was also downregulated. Together, these findings indicate a role for miRNAs in the control of tissue regression and cell death in a characteristic morphogenetic embryonic process based on massive apoptosis.
- español
