Resumen de Evolución cromosómica del clúster drosphila martensis: origen de las inversiones y reutilización de los puntos de rotura
Con el fin de ampliar el conocimiento sobre el mecanismo molecular de cómo se generan las inversiones fijadas en el género Drosophila, hemos llevado a cabo un estudio de las inversiones fijadas en el cromosoma 2 de D. uniseta mediante la cartografía comparativa de 82 clones BAC de D. buzzatii. Los resultados muestran que el cromosoma 2 de las dos especies difiere en al menos cinco inversiones. Dos de estas inversiones, 2f2 y 2x3, habían pasado desapercibidas en estudios citológicos previos debido a que son solapantes y ocupan aproximadamente el mismo segmento cromosómico. Las otras tres inversiones, 2e2, 2t6 y 2u6, ya estaban descritas en D. uniseta. Se han identificado los clones BAC que contienen los puntos de rotura de las cinco inversiones y se han observado una coincidencia de tres puntos de rotura entre las cinco inversiones. Hemos secuenciado los extremos de los clones BAC que contienen los puntos de rotura y hemos secuenciado completamente el BAC 1B03, que contiene los puntos de rotura proximales de 2f2 y 2x3 así como el punto de rotura distal de 2u6. Con ayuda de toda esta información se han cartografiado de forma precisa los cinco puntos de rotura de las inversiones 2f2, 2x3 y 2u6 en los genomas de D. mojavensis y D. buzzatii (que representan la ordenación ancestral, no invertida). Los puntos de rotura proximales de las inversiones 2f2 y 2x3 coinciden en la misma región intergénica dentro del BAC 1B03 mientras el punto de rotura distal de la inversión 2u6 está situado a una distancia de unos 15 kb de los otros dos dentro del BAC 1B03. Mediante el uso de una genoteca de fagos lambda de D. uniseta se han aislado y secuenciado también los puntos de rotura de las tres inversiones en esta especie (que representa la ordenación invertida). Un pequeños fragmento duplicado en orientación opuesta en ambos extremos de la inversión 2f2 sugiere que esta inversión se originó por el mecanismo de roturas de cadena sencilla escalonadas en un extremo y rotura de cadena doble en el otro seguidas de reparación por NHEJ de los dos fragmentos generados. Por el contrario, se observaron copias del trasposon BuT5 en ambos puntos de rotura de la inversión 2x3 lo que sugiere que el mecanismo mas probable que originó esta inversión fue la recombinación ectópica entre copias de este TE. Fragmentos de copias de Galileo detectadas en ambos puntos de rotura de la inversión 2u6, indicarían que posiblemente dos copias completas de este TE insertadas en el cromosoma 2 ancestral de esta especie pudieron originar esta inversión por recombinación ectópica entre copias de este TE.
Por último, fueron analizados cinco genes adyacentes al punto de rotura proximal de la inversión 2u6. Este análisis mostró que estos cinco genes pertenecen a una familia génica compuesta por 21 grupos ortólogos y un total de 233 genes presentes en los 12 genomas de Drosophila. Los análisis filogenéticos y de posición citológica de cada uno de los 233 genes indican que el origen de estos genes que codifican factores de transcripción con dedos de zinc tipo AD y tipo C2H2 se ajusta al modelo de evolución de nacimiento y muerte de copias de una familia génica.
