Los actinomicetos, una de las comunidades mayoritarias de la población microbiana presente en los suelos, pueden también encontrarse habitando una amplia diversidad de entornos ecológicos. En el presente trabajo, hemos explorado el uso de líquenes como una fuente alternativa para el aislamiento de nuevos actinomicetos. Los líquenes son el resultado de la simbiosis entre un hongo, un alga verde y/o cianobacterias y, mientras que estos componentes simbióticos han sido ampliamente descritos, la comunidad microbiana que habita este nicho ecológico no ha sido bien caracterizada. Hemos estudiado la diversidad de la población de actinomicetos aislados de líquenes procedentes de zonas tropicales de las islas de Hawai y de Reunión y de zonas frías de Alaska. La diversidad de la población microbiana se evaluó mediante el análisis de los ácidos grasos y mediante un tipado (fingerprinting) molecular. También hemos realizado una prospección en las cepas de genes asociados a la producción de metabolitos secundarios haciendo uso de una amplificación mediante PCR para evaluar el potencial biosintético de estas cepas; los perfiles obtenidos de cada cepa se compararon con la actividad antimicrobiana mostrada por estas cepas en condiciones de laboratorio. Nuestros resultados demuestran que los líquenes representan un reservorio extremadamente rico para el aislamiento de una amplia diversidad de actinomicetos, muchos de los cuales representan todavía hoy una gran fuente de metabolitos secundarios sin descubrir.
Actinomycetes, one of the major communities of the microbial population present in soil, can also be found inhabiting a wide diversity of ecological sources. We have explored the use of lichens as an alternative source for the isolation of novel actinomycetes. Lichens are symbiotic mixtures of fungi, green algae and/or cyanobacteria and whereas these symbiotic components have been extensively described, the microbial community inhabiting this niche has not been well characterized. We studied the diversity of the actinomycete population isolated from lichens collected in tropical areas from the Hawaii and Reunion islands and in cold areas from Alaska. The diversity of the microbial population was evaluated using fatty acid analysis and molecular fingerprinting. A PCR approach to screen the isolates for genes associated with secondary metabolite production was applied to evaluate the biosynthetic potential of these strains; profiles obtained for each isolate were compared to the antimicrobial activity exhibited by these isolates in laboratory conditions. Our results demonstrate that lichens represent an extremely rich reservoir for the isolation of a wide diversity of actinomycetes many of them representing still today a rich untapped source of secondary metabolites.
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