Aplicación del puntaje de riesgo poligénico de colesterol-LDL elevado de seis SNP en población argentina con fenotipo de hipercolesterolemia familiar
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Virginia Bañares [2] ; Javier Martin [3] ; Graciela López [1] ; Pablo Corra [4] ; Laura Schreier [1]
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[1] Universidad de Buenos Aires
Universidad de Buenos Aires
Argentina
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[2] Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud “Dr Carlos Malbrán”, Centro Nacional de Genética Médica, Departamento de Genética Experimental, Ciudad Autónoma de Buenos Aires
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[3] Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud “Dr Carlos Malbrán”, Centro Nacional de Genética Médica, Departamento de Genética Clínica, Ciudad Autónoma de Buenos Aires
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[4] Universidad FASTA, Facultad de Medicina, Instituto de Investigaciones Clínicas, Mar del Plata, Buenos Aires. Argentina
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- Localización: Gaceta médica de México, ISSN 0016-3813, Vol. 160, Nº. 4, 2024, págs. 435-441
- Idioma: español
- Títulos paralelos:
- Application of the 6-SNP elevated LDL-cholesterol polygenic risk score in individuals with familial hypercholesterolemia phenotype from an Argentine population
- Enlaces
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Resumen
- español
Introducción: Un nivel de colesterol-LDL > 190 mg/dL indica hipercolesterolemia severa de origen monogénico y/o poligénico.
Los puntajes de riesgo genético (GRS) evalúan potenciales causas poligénicas. Objetivo: Aplicar el GRS de seis SNP (GRS-6) en individuos con hipercolesterolemia severa. Material y métodos: Se estudiaron 69 sujetos del registro de detección de hipercolesterolemia familiar (HF) en Argentina. Resultados: Con 44 individuos con fenotipo de HF sin variantes genéticas que indicaran origen monogénico (HF/M−) y 26 sujetos de control, se estableció el valor de corte de GRS-6 en > 0.76, con sensibilidad de 0.59 y especificidad de 0.69; 15 sujetos HF/M− (34 %) presentaron GRS-6 positivo. Los valores medios del GRS-6 en los pacientes con HF/M−, HF/M+ y los sujetos de control fueron 0.72 ± 0.17, 0.66 ± 0.17 y 0.70 ± 0.13 (p = 0.43).
No existieron diferencias significativas en los valores de colesterol, ni en el puntaje clínico, entre los casos con GRS-6 positivo versus negativo. En 32 % de los casos se obtuvieron valores positivos para contribución poligénica con GRS-6 versus 20 % con GRS-10, puntaje que previamente había sido aplicado (p = 0.003). Conclusión: Describimos el primer valor de corte para el GRS-6 en una población latinoamericana, y concluimos que este GRS podría aportar a la evaluación de la contribución poligénica en los pacientes con hipercolesterolemia severa en la población argentina de manera similar a la de otras poblaciones europeas.
- English
Introduction: LDL-cholesterol greater than 190 mg/dL indicates severe hypercholesterolemia (HS) of monogenic and/or polygenic origin. Genetic risk scores (GRS) evaluate potential polygenic causes. Objective: We applied a GRS of 6-SNP (GRS-6) in HS individuals. Material and methods: 69 subjects from the Familial Hypercholesterolemia (HF) Detection registry in Argentina (Da Vinci). Results: With 44 individuals with HF-phenotype, not carriers of genetic variants that indicate a monogenic origin (HF/M−) and 26 controls, the GRS-6 cut-off value was established, > 0.76, sensitivity 0.59, specificity 0.69.
15/44(34 %) HF/M− presented GRS-6+. The mean GRS-6 values in HF/M−, HF/M+ and controls were 0.72 ± 0.17, 0.66 ± 0.17, and 0.70 ± 0.13 respectively (p = 0.43). There were no significant differences in cholesterol values, or in the clinical score, between cases with positive vs negative GRS-6. The GRS-6 was positive in 32 % of the cases vs 20 % of the previously applied GRS-10 (p = 0.003), significantly increasing the detection of polygenic contribution. Conclusions: We present an estimate of the first cut-off value for the GRS-6 in a Latin American population, and we conclude that the GRS-6 could contribute to the evaluation of the polygenic contribution in cases with severe hypercholesterolemia in our population in a similar way to that of other European populations.
- español
