Resumen de PESPAD: una nueva herramienta para la predicción de la estructura secundaria de la proteína basada en árboles de decisión

Claudia Ximena Mazo Vargas, Oscar F. Bedoya

• español

  Una de las tareas que actualmente enfrentan los bioinformáticos es la predicción de la estructura secundaria de la proteína. Este problema consiste en que dada una secuencia de aminoácidos, se debe predecir la estructura de cada residuo, siendo hélices y hojas las más comunes. A pesar de los avances que se han logrado al plantear modelos para la predicción de la estructura secundaria, se intenta mejorar su exactitud predictiva. En este artículo se presenta una nueva herramienta para la predicción de la estructura secundaria de la proteína, llamada PESPAD, que supera significativamente la exactitud predictiva de los métodos individuales existentes. La herramienta se apoya en modelos construidos con base en árboles de decisión para la mezcla de expertos.

• English

  Predicting the secondary structure of the protein is a central problem in bioinformatics. The problem is focused on try to predict the structure of each residue given the amino acid sequence. The most common secondary structures are helix and - sheets. Despite the progress made in making models for predicting the secondary structure, there is still a need to improve their predictive accuracy. This paper presents a new tool for predicting the secondary structure of the protein, called PESPAD, which significantly exceeds the accuracy of predictive methods available now. The tool is based on models constructed by using decision trees for the mixture of experts.