Comparison of partial and full VP2 gene sequences of parvovirus from domestic cats in Turkey

• Akkutay-Yoldar, Zeynep ^[2] ; Taylan Koç, B. ^[1]
  1. [1] Adnan Menderes University

     Adnan Menderes University

     Turquía

     
  2. [2] Department of Virology. Faculty of Veterinary Medicine. Ankara University.Turkey
• Localización: Veterinaria México, ISSN 0301-5092, Vol. 6, Nº. 4, 2019, págs. 41-53
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Comparación de secuencias parciales y completas del gen VP2 del parvovirus de gatos domésticos en Turquía
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• Resumen
  • español

    Los parvovirus son patógenos ubicuos que causan una enfermedad mortal en los gatos y pueden mutar para la transmisión entre especies. Tanto el virus de la panleucopenia felina (FPV) como el parvovirus canino (CPV), con sus variantes antigénicas, inducen en gatos una enfermedad que se presenta con signos similares. El objetivo de este estudio fue determinar la presencia de parvovirus en muestras de sangre y exudado de cinco gatos clínicamente sintomáticos (de Ankara, Turquía). El gen que codifica la proteína estructural de la cápside VP2 de los parvovirus obtenidos se amplificó mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR), se purificó y se secuenció parcial o casi en su longitud. Para la caracterización molecular se utilizó el método de máxima verosimilitud (ML). El análisis filogenético basado en la secuenciación casi completa del gen VP2 y la disposición de los aminoácidos mostró que cuatro de las cepas virales estaban estrechamente relacionadas y localizadas en el mismo grupo de FPV. La quinta cepa encontrada estaba ubicada en el mismo grupo pero en una rama separada. Las cepas de campo viral se incluyeron en el grupo CPV-2 según lo determinado mediante análisis parcial del genoma: cuatro encajadas en el CPV-2c y una en un clado separado dentro del grupo CPV-2b. Hasta donde sabemos, este es el primer informe que detalla la caracterización casi completa del gen VP2 en gatos turcos. En general, los contrastes de VP2 de longitud casi completa fueron más efectivos para determinar el origen de las cepas de parvovirus que las comparaciones de longitud parcial

  • English

    Parvoviruses are ubiquitous pathogens that cause a fatal disease in cats and are able to mutate for cross-species transmission. Both the feline panleukopenia virus (FPV) and the canine parvovirus (CPV), with their antigenic variants, induce a disease in cats that presents with similar signs. The aim of this study was to determine the presence of parvoviruses in blood and exudate samples from five clinically symptomatic cats (from Ankara, Turkey). The gene coding for the VP2 structural capsid protein of the obtained parvoviruses was amplified by polymerase chain reaction (PCR), purified and partially or nearly full-length sequenced. The maximum likelihood (ML) method was used for molecular characterization. Phylogenetic analysis based on nearly full-length sequencing of the VP2 gene and amino acid arrangement showed that four of the viral strains were closely related and localized in the same FPV cluster. The fifth strain found was located in the same cluster but on a separate branch. Viral field strains were included in the CPV-2 group as determined by partial genome analysis: four fitted in the CPV-2c, and one in a separate clade within the CPV-2b group. To our knowledge, this is the first report that details nearly full-length VP2 gene characterisation in Turkish cats. Overall, nearly full-length VP2 contrasts were more effective to determine the origin of parvovirus strains, than partial length comparisons