Molecular identification and phylogenetic reconstruction of marine fish from Kutaradja fish landing Station, Banda Aceh

• Andriyono, S. ^[1] ; Damora, A. ^[3] ; Hidayani, A.A. ^[2]
  1. [1] Airlangga University

     Airlangga University

     Indonesia

     
  2. [2] Hasanuddin University

     Hasanuddin University

     Indonesia

     
  3. [3] Universitas Syiah Kuala, Aceh, Indonesia.

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• Localización: Archivos de zootecnia, ISSN-e 1885-4494, ISSN 0004-0592, Vol. 73, Nº 283, 2024, págs. 124-132
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Identificación molecular y reconstrucción filogenética de peces marinos de la estación de desembarque de pescado de Kutaradja, Banda Aceh.
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• Resumen
  • español

    Se espera que el gran potencial de los recursos marinos que posee la provincia de Banda Aceh se utilice de manera óptima. La identificación completa de los recursos de peces marinos es un requisito importante para apoyar su utilización y preservación en la provincia de Banda Aceh. En este estudio, se lleva a cabo un enfoque de identificación molecular, además de realizar una identificación morfológica que ha sido comúnmente utilizada. En este estudio de identificación molecular, el ADN objetivo es la región de la subunidad I de la citocromo c oxidasa (COI) ubicada en las mitocondrias. El método de extracción utilizó un Kit de ADN que se ajustó a las directrices del fabricante, luego continuó con PCR para duplicar el ADN extraído. Los resultados de la PCR se llevaron a cabo mediante secuenciación directa y el análisis de secuencias se realizó utilizando los software Chromas y Mega7. Los resultados obtenidos fueron 47 secuencias de COI generadas representando 33 géneros, 19 familias y 5 órdenes. Los Perciformes fueron el grupo de peces más predominante, y se identificaron varias especies de peces con importante valor económico como el grupo Scombridae, incluyendo Thunnus albacares, Auxis thazard y Katsuwonus pelamis. A partir de la secuencia resultante, hay un haplotipo de la familia Scombridae, dos haplotipos de la familia Carangidae y dos haplotipos de la familia Serranidae. Este estudio es esencial en estudios de biología pesquera y otros estudios de pesquerías para apoyar la utilización sostenible del potencial de pesquerías marinas en Banda Aceh

  • English

    The large potential of marine resources possessed by Banda Aceh Province is expected to be utilized optimally. Complete identification of marine fish resources is an important requirement in order to support their utilization and preservation in Banda Aceh Province. In this study, a molecular identification approach is carried out in addition to conducting a morphological identification that has been commonly used. In this molecular identification study, the target DNA is the Cytochrome c oxidase subunit I (COI) region located in the mitochondria. The extraction method used a DNA Kit that was adjusted to the manufacturer’s guidelines, then continued with PCR to duplicate the extracted DNA. The PCR results were carried out by direct sequencing and sequence analysis was performed using Chromas and Mega7 software. The results obtained were 47 COI sequences were generated representing 33 genera, 19 families, and 5 orders. Perciformes was the most predominant group of fish, and several fish species with important economic value were identified such as the Scombridae group including Thunnus albacares, Auxis thazard, and Katsuwonus pelamis. From the resulting sequence, there are one haplotype from the Scombridae family, two haplotypes from the Carangidae family, and two haplotypes from the Serranidae family. This study is essential in fisheries biology studies and other fisheries studies to support the sustainable utilization of marine fisheries potential in Banda Aceh