Nuevo caso de variantes patogénicas homocigotas de los genes TBCK y DHCR7

• Gutiérrez-Vargas, Maria Camila ^[1] ; Ostos-Alfonso, Henry ^[2]
  1. [1] Universidad Surcolombiana

     Universidad Surcolombiana

     Colombia

     
  2. [2] Universidad Surcolombiana, Hospital Universitaria Hernando Moncaleano Perdomo
• Localización: Revista médica Iatreia, ISSN-e 2011-7965, ISSN 0121-0793, Vol. 36, Nº. 2, 2023, 1 págs.
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • New Case of Homozygous Pathogenic Variants in TBCK and DHCR7 Genes
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    Introducción: las variantes en el gen TBCK se relacionan con el síndrome de hipotonía infantil con retraso psicomotor y facies característica tipo 3 (IHPRF3). El gen DHCR7 se asocia con el síndrome de Smith-Lemli-Opitz(SLOS).Objetivo: describir nuevo caso de variantes patogénicas homocigotas de los genes TBCK y DHCR7.Metodología: masculino de 15 meses, primogénito de padres consanguíneos, antecedentes familiares en primer grado de retraso cognitivo (madre) y en cuarto grado. Nació a las 38 semanas vía cesárea. RMN cerebral conalteración de migración y posmigración temporo-occipital bilateral, fosa posterior disminuida de tamaño, plagiocefalia posterior derecha. Peso -1,84 DS, talla -1,99 DS, perímetro cefálico -2,13 DS, plagiocefalia derecha, no fija mirada, orejas desplegadas, oreja izquierda rotada hacia atrás, implantación baja, nariz pequeña, ojos hundidos, órbitas poco profundas, leve pectus excavatum, hidrocele, pliegue simiano bilateral, hipotonía, no control cefálico.Hallazgos: cariotipo normal, exoma clínico con mutación en gen TBCK variante DNA c.412dupT (p.Tyr138fs*8) homocigota de significado clínico probablemente patogénica. En gen HUWE1 c.10514C>T (p.Pro3505Leu)presenta hemicigota de significado clínico incierto, predictores de silico indican variante benigna y en el gen DHCR7 c.506C>T (p.Ser169Leu) homocigota de significado clínico incierto.Discusión: las características compartidas son el retraso en el neurodesarrollo, la hipotonía y la microcefalia. Para IHPRF3 los rasgos faciales, retraso del habla, hallazgos en la RM cerebral. Mientras que para SLOS la nariz escorta y la baja talla.Conclusiones: nuestro paciente presenta dos variantes patogénicas (TBCK y DHCR7).

  • English

    Introduction: Variants in the TBCK gene are associated with Infantile Hypotonia with Psychomotor Retardation and Characteristic Facies Type 3 (IHPRF3) syndrome. The DHCR7 gene is associated with Smith-Lemli-Opitz syndrome (SLOS).

    Objective: To describe a new case of homozygous pathogenic variants in the TBCK and DHCR7 genes.

    Methods: A 15-month-old male, the first child of consanguineous parents, with a family history of first-degree cognitive delay (mother) and fourth-degree relatives. He was born by cesarean section at 38 weeks. Brain MRI showed bilateral temporal-occipital alteration of migration and post-migration, reduced posterior fossa size, and right posterior plagiocephaly. He had a weight of -1.84 SD, height -1.99 SD, head circumference -2.13 SD, right plagiocephaly, non-fixed gaze, unfolded ears, left ear rotated backward, low implantation, small nose, sunken eyes, shallow orbits, mild pectus excavatum, hydrocele, bilateral simian crease, hypotonia, and no head control.

    Findings: Normal karyotype, clinical exome sequencing revealed a homozygous pathogenic variant in the TBCK gene (DNA variant c.412dupT, p.Tyr138fs*8) of probable clinical significance. In the HUWE1 gene, there was a hemizygous variant (c.10514C>T, p.Pro3505Leu) of uncertain clinical significance, with in silico predictors indicating a benign variant. In the DHCR7 gene, there was a homozygous variant (c.506C>T, p.Ser169Leu) of uncertain clinical significance.

    Discussion: Shared features include developmental delay, hypotonia, and microcephaly. For IHPRF3, facial features, speech delay, and brain MRI findings are characteristic, while for SLOS, a short nose and low stature are common.

    Conclusions: Our patient has two pathogenic variants (TBCK and DHCR7).