Resumen de Descripción físico-química teórica y computacional de los complejos enzima-ligando de la proteína bromelina reportada mediante difracción de Rayos X

Fabián Mauricio Santana Romo, Marcia Jimena Morales Ortíz, Aurora Carreño Otero, Gabriela Elena Vizuete Fiallos, Jessica Lorena Peñaherrera Veintimilla

• español

  El estudio teórico computacional aborda la descripción de los complejos enzima-ligando obtenidos mediante el método de difracción de Rayos X. El propósito de este estudio es analizar a la enzima bromelina aplicando de la química computacional, a través de cribados virtuales consecutivos en la plataforma del RCSB PDB hasta llegar al cristal de mejor calidad reportada. La descripción física de la obtención de coordenadas tridimensionales a través del modelo de difracción de Rayos X, y la aplicación de la química teórica y computacional para describir la proteína cuaternaria reportada con sus cadenas, ligandos asociados, y moléculas de agua estructural. Se determinó que el complejo cristalino ID PDB: 6YCB es el que posee la mejor resolución, comparándola con respecto a la proteína en criogenia que minimiza sus vibraciones estructurales.

• English

  The computational theoretical study describes the enzyme-ligand complexes obtained by the X-Ray diffraction method. This study aims to analyze the enzyme bromelain by applying computational chemistry through consecutive virtual screenings on the RCSB platform. PDB until reaching the crystal of best-reported quality. The physical description of obtaining three-dimensional coordinates through the X-Ray diffraction model and applying theoretical and computational chemistry to describe the reported quaternary protein with its chains, associated ligands, and structural water molecules. It was determined that the crystalline complex PDB ID: 6YCB has the best resolution compared to the cryogenic protein that minimizes its structural vibrations.