Aproximación metagenómica para evaluar el efecto de fármacos en el microbioma en un diseño experimental de microcosmos

• A. M. Herruzo-Ruiz ^[1] ; C. Michán ^[1] ; J. Alhama ^[1]
  1. [1] Universidad de Córdoba

     Universidad de Córdoba

     Cordoba, España

     
• Localización: Nuevos desafíos, nuevas oportunidades: IX Congreso Científico de Investigadores en Formación de la Universidad de Córdoba. Córdoba, 3 al 6 de mayo, 2021, ISBN 978-84-9927-640-3, págs. 145-149
• Idioma: español
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• Resumen
  • español

    La contaminación química es una de las principales consecuencias de la actividad humana sobre los ecosistemas marinos. Actualmente los fármacos constituyen un contaminante emergente de interés por sus potenciales efectos nocivos y su extendido uso. Un diseño experimental de microcosmos/multiespecies permite evaluar la respuesta a los contaminantes en organismos bioindicadores de distintos niveles tróficos. Hemos estudiado el nivel inferior, el microbioma de sedimentos marinos, evaluando el efecto de la exposición a dos concentraciones distintas (5y 50 µg/L) fármacos comúnmente prescritos en la población: antiinflamatorios (Diclofenaco e Ibuprofeno), antibióticos (Cicloproxacina y Flumequina) y antidepresivos (Lorazepan y Paroxetina), tanto de forma individual como su mezcla. Los microorganismos fueron identificados mediante secuenciación del 16S rRNA, estudiando los cambios de diversidad mediante el índice de Shannon-Wiener’s (H’). Comparando las dos concentraciones frente al control, se obtuvieron cambios significativos en únicamente un filo, tanto para antiinflamatorios (Nitrospinae) como para antidepresivos (Spirocheates), mientras que en los antibióticos se produjeron cambios en varios filos (Plactomycetes, Bacteroidetes, Chlamydiae, etc.), todos ellos tras las exposiciones individuales.

  • English

    Chemical pollution is one of the main consequences of human activity on marine ecosystems. Nowadays, pharmaceutical compounds constitute emerging pollutants of interest due to their potential adverse effects and their widespread use. An experimental microcosm/multispecies design allows to evaluate the response to pollutants in bioindicator organisms from different trophic levels. The sediment microbiome, at the lower trophic level, was studied by evaluating the effect of exposure to two different concentrations (5 and 50 μg/L) of commonly prescribed drugs: anti-inflammatories (Diclofenac and Ibuprofen), antibiotics (Cycloproxacin and Flumequine) and antidepressants (Lorazepan and Paroxetine), both individually and in mixtures. Microorganisms were identified by DNA sequencing of their16S rRNA, and the alpha diversity of the communities was determined at the family level using the Shannon–Wiener´s (H’) index. When comparing the two concentrations against the control, significant changes were obtained only in one phyllum after anti-inflammatory (Nitrospinae) or antidepressant (Spirocheates) treatments, while several phylla (Plactomycetes, Bacteroidetes, Chlamydiae, etc.) changed afteri ndividual exposure to antibiotics.