Identificación de una agrupación génica que codifica para ARN pequeños de nucléolo en Trypanosoma rangeli

• Autores: Concepción J. Puerta
• Localización: Infectio: Revista de la Asociación Colombiana de Infectología, ISSN-e 2422-3794, ISSN 0123-9392, Vol. 9, Nº. 4, 2005
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Identification of a Genetic Cluster Coding for Six Small Nucleolar RNA in Trypanosoma rangeli
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    Objetivo. Realizar un análisis in silico de un fragmento de 801 pb de Trypanosoma rangeli,previamente reportado como codificante para el ARN pequeño de nucléolo C1, perteneciente ala familia de los C/D snoARN.Materiales y métodos. El tamizaje de las secuencias se realizó en las bases de datos de los diferentes proyectos de genomas de los parásitos usando el programa BLASTN. Las alineaciones de las secuencias se hicieron con los programas L-ALIGN y Clustal W.Resultados.La secuencia C1 constituye una agrupación génica que codifica para seis ARN pequeños de nucléolo, tres pertenecientes a la familia C/D snoARN y tres a la famila H/ACAsno ARN.Conclusión. Los ARN pequeños de nucléolo de Trypanosomatidae presentan una organización genómica similar y elevados porcentajes de identidad en las secuencias consenso, lo cual unido a las funciones de estos ARN en el procesamiento y modificación posteriores a la transcripcióndel ARN ribosómico y, también, en el proceso de "trans splicing", hace de estas moléculas unblanco atractivo para el control de estos parásitos.

  • English

    Objective. To perform an in silico assay of a 801 bp fragment of Trypanosoma rangeli, previously reported as coding for C1 small nucleolar RNA belonging to the family of C/D snoRNAs.Materials and methods. The screening of sequences was performed with the different parasite genome project databases using the BLASTN program. Sequence alignments were done using the L-ALIGN and Clustal W programs.Results. Sequence C1 constitutes a genetic cluster coding for six small nucleolar RNA, three belonging to the C/D snoRNA family and three belonging to the H/ACA snoRNA family.Conclusion. Small nucleolar RNAs of Trypanosomatidae exhibit a similar genomic organization and high percentages of identity in the consensus sequences. Considering also the function of these RNAs in the processing and post-transcriptional modification of ribosomal RNA and in the trans-splicing process, it is possible to conclude that these molecules are attractive targets for control of these parasites.