Resumen de Bacterias cultivables resistentes a oxitetraciclina durante el proceso de vermicompostaje de excretas bovinas

Lorena Uribe Lorío, Rodolfo WingChing-Jones, Daniela Vidaurre Barahona, Lidieth Uribe, Luis Felipe Arauz

• español

  Introducción: A nivel mundial se han detectado bacterias con genes de resistencia al antibiótico oxitetraciclina en estiércol de vacas lecheras, sin embargo, es una práctica común utilizar este estiércol como fertilizante. El vermicompostaje puede reducir el problema, pero este tema no ha sido evaluado en Costa Rica. Objetivo: Analizar la presencia de bacterias resistentes a la oxitetraciclina durante el vermicompostaje en una finca lechera costarricense. Métodos: A partir de estiércol fresco, precompostado, lombricomposta, y tés de composta con y sin melaza y tés de composta con y sin melaza, inoculamos caldos suplementados con oxitetraciclina. Extrajimos el ADN de estos cultivos líquidos y secuenciamos en masa el amplicón ribosómico 16S. Resultados: Clasificamos 105 292 secuencias en 58 variantes de secuencia de amplicón de caldos suplementados con oxitetraciclina, la mayoría identificadas como Proteobacteria, Bacteroidetes y Firmicutes. El estiércol fresco tuvo más bacterias resistentes (32), seguido de los “tés” sin y con melaza. El precompostaje y el vermicompostaje disminuyeron la cantidad y variedad de bacterias resistentes. Sin embargo, la preparación de los tés provocó la multiplicación de géneros bacterianos reconocidos por su capacidad de acumular determinantes de resistencia. Conclusión: El precompostaje y el vermicompostaje disminuyeron el número y tipo de bacterias resistentes.

   

• English

  Introduction: Bacteria with resistance genes to the antibiotic oxytetracycline have been detected in dairy cow manure worldwide, however, it is common a practice to use this manure as fertilizer. Vermicomposting can reduce the problem, but this subject has not been evaluated in Costa Rica. Objective: To analyze the presence of bacteria resistant to oxytetracycline during vermicomposting in a Costa Rican dairy farm. Methods: We inoculated broths supplemented with oxytetracycline from fresh manure, precomposted manure, vermicompost and "compost teas" with and without molasses. We prepared “compost teas” with and without molasses from this sample. We extracted DNA from these liquid cultures and mass-sequenced the 16S ribosomal amplicon. Results: We classified 105 292 sequences in 58 amplicon sequence variants from broths supplemented with oxytetracycline, most of them identified as Proteobacteria, Bacteroidetes and Firmicutes. Fresh manure had the most resistant bacteria (32), followed by the “teas” without and with molasses. Precomposting and vermicomposting decreased the number and type of resistant bacteria. However, preparation of the teas caused the multiplication of bacterial genera recognized for their ability to accumulate resistance determinants. Conclusion: Precomposting and vermicomposting decreased the number and type of resistant bacteria.