Identificación de aislados de Phytophthora spp. obtenidos de cultivos de cacao en Antioquia, Colombia

• Autores: Carlos Andrés Palacios Bejarano, Lucía Afanador Kafuri, Juan Manuel Pardo García
• Localización: Acta Agronómica, ISSN-e 2323-0118, ISSN 0120-2812, Vol. 70, Nº. 1, 2021, págs. 17-26
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Identification of Phytophthora spp. isolates obtained from cocoa crops in Antioquia, Colombia
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    Con el objetivo de identificar las especies de Phytophthora asociadas a la mazorca negra y al cáncer del tallo del cacao en Antioquia, Colombia, se realizó la caracterización e identificación morfológica y molecular de 120 aislados de Phytophthora spp. obtenidos de mazorcas, tallos y muestras de suelo en 11 municipios de este departamento. Se evaluaron caracteres morfológicos en esporangios y clamidosporas, la formación de estructuras sexuales, el patrón y la tasa de crecimiento de las colonias y las temperaturas cardinales. La identificación molecular se llevó a cabo mediante PCR convencional con cebadores género-específicos y qPCR. Los 120 obtenidos se identificaron como Phytophthora, 119 como P. palmivora y la cepa CH6-3S no coincidió con ninguna especie de Phytophthora previamente reportada como patógena de cacao. Un modelo de escalamiento multidimensional basado en atributos morfológicos mostró una amplia diversidad en el tamaño y forma de los esporangios (ocho morfotipos); sin embargo, la variabilidad de los aislados fue baja (17 %) y los subgrupos formados no mostraron relación con las localidades, ni con el tipo de tejido de donde se obtuvieron.

  • English

    With the aim to identify the Phytophthora species associated with black pod and stem canker diseases of cocoa in Antioquia, 120 isolates were evaluated using morphological and molecular approaches of Phytophthora spp. isolates obtained from pod, stem, and soil samples collected in 11 municipalities. Morphological characters in sporangia and chlamydospores, formation of sexual structures, pattern and growth rate of the colonies, and cardinal temperatures were evaluated. Molecular identification was done by conventional PCR and qPCR. The 120 obtained were identified as Phytophthora, 119 isolates belong to P. palmivora, and the strain CH6-3S was not associated with any Phytophthora species previously reported as a cocoa pathogen. A multidimensional scaling model based on morphological attributes showed a wide diversity in the size and shape of the sporangia (eight morphotypes). However, variability among isolates was low (17 %), and the formed subgroups do not correspond to locations, nor to the tissue type from which they were obtained.