El cerezo (Prunus avium L.) es una especie mayoritariamente autoincompatible. La incompatibilidad floral implica que las variedades de cerezo necesitan de la presencia de variedades polinizadoras para obtener cuajado. Pero, además, muchas variedades son también interincompatibles, lo que hace necesario conocer con precisión las relaciones de intercompatibilidad para establecer correctamente las plantaciones. Aunque la compatibilidad entre algunas variedades es bien conocida, la constante aparición de nuevas obtenciones hace necesario actualizar constantemente los estudios de las relaciones de compatibilidad. Los métodos tradicionales para establecer estas relaciones son eficaces pero están limitados a la existencia de flores para llevar a cabo los ensayos de compatibilidad. La aparición de técnicas moleculares basadas en el ADN ha permitido agilizar este proceso, ya que permiten establecer las relaciones de compatibilidad entre variedades independientemente de la edad del árbol o del momento del año. En este trabajo se describe una metodología basada en el ADN que permite identificar los alelos de incompatibilidad de diferentes variedades de cerezo. La utilidad de esta metodología ha sido comprobada mediante su aplicación para la identificación de los grupos de incompatibilidad de variedades ampliamente utilizadas y no descritas hasta el momento y la confirmación del grupo de incompatibilidad de otras variedades ya estudiadas previamente. La metodología descrita puede ser aplicada igualmente a otras especies frutales con genotipos autoincompatibles como el almendro, el albaricoquero, el ciruelo o el manzano.
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