Utilização de marcadores microssatélites para avaliação da diversidade genética de variedades locais de mandioca
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Eliane Cristina Moreno de Pedri [2] ; Giovana Cuchi [2] ; Auana Vicente Tiago ; Ana Aparecida Bandini Rossi [1]
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[1] Universidade do Estado de Mato Grosso
Universidade do Estado de Mato Grosso
Brasil
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[2] Universidade do Estado de Mato Grosso Carlos Alberto Reyes Maldonado
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- Localización: Revista Verde de Agroecologia e Desenvolvimento Sustentável, ISSN-e 1981-8203, Vol. 19, Nº. 1, 2024, págs. 23-29
- Idioma: portugués
- Títulos paralelos:
- Use of microsatellite markers to evaluate the genetic diversity of local cassava landraces
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Resumen
- português
A mandioca é cultivada pelos agricultores familiares que conservam em suas propriedades variedades locais, atuando como mantenedores desse importante recurso genético. A diversidade genética existente para a espécie pode ser estimada por meio de marcadores moleculares microssatélites. Assim, objetivou-se realizar a caracterização molecular de quatro variedades locais de mandioca (Cacau Branca, Cacau Roxa, Cacau Amarela e Mandioca Pão) cultivadas por agricultores familiares no município de Apiacás-MT, utilizando marcadores microssatélites. Foram amostradas quatro variedades locais de mandioca, totalizando 40 indivíduos. O material foliar foi utilizado para a extração do DNA total e para as amplificações via PCR (Polymerase Chain Reaction). Foram amplificados 67 alelos, sendo que os locique amplificaram o maior e o menor número de alelos, foram SSRY126 e SSRY21, respectivamente. Dentre os alelos amplificados foram identificados 33 alelos raros (49%). Os valores médios de heterozigosidade observada (0,840) foram superiores aos valores de heterozigosidade esperada (0,643), refletindo em índices de fixação negativos. Dentre os locitestados, os que apresentaram valores de PIC acima de 0,5 foram: GA12; GA131; GA140; SSRY27; SSRY28; SSRY126. O dendrograma formado pelo método de agrupamento hierárquico UPGMA gerou cinco grupos genéticos que estão em concordância com a análise bayesiana. Sendo assim, foi observado que há diversidade genética entre as variedades locais cultivadas por agricultores familiares do município de Apiacás. Os indivíduos AP5 (Cacau Branca) e AP20 (Cacau Roxa) são os mais divergentes geneticamente entre o conjunto analisado e a variedade Mandioca pãoestá mais distante geneticamente das outras três variedades (Cacau Branca, Cacau Roxa, Cacau Amarela).
- English
Cassavais cultivated by family farmers who preserve local landraces in their proprieties, acting as guardians of this genetic resource. The existing genetic diversity for the species can be estimated using microsatellite molecular markers. Thus, the objective was then to carry out the molecular characterization of four local varieties of cassava (Cacau Branca, Cacau Roxa, Cacau Amarela and Mandioca Pão) cultivated by family farmers in the municipality of Apiacás, Mato Grosso state, Brazil using microsatellite markers. Four local landraces of cassava were sampled, totaling 40 individuals. Leaf material was used for DNA extraction and PCR amplification. A total of 67 alleles were amplified, with SSRY126 and SSRY21 amplifying the highest and lowest number of alleles,respectively. Among the amplified alleles, 33 rare alleles (49%) were identified. The observed heterozygosity (0.840) was higher than the expected heterozygosity (0.643), reflecting negative fixation indices. Lociwith PIC values above 0.5 were GA12, GA131, GA140, SSRY27, SSRY28, and SSRY126. The dendrogram formed by the UPGMA hierarchical clustering generated five genetic clusters, which were in agreement with the Bayesian analysis. Thus, genetic diversity was observed among the local landraces cultivatedin the family farmers' fields in the municipality of Apiacás. The AP5 and AP20 individuals are the most genetically divergent among the analyzed group, and the Mandioca pãolandrace is the most genetically distant from the other three landraces.
- português
