Screening the microbiota of hepatopancreas associated with toxin genes pirABVP in Penaeus van-namei: SCREENING THE MICROBIOTA OF HEPATOPANCREAS

• Ávila-Villa, Luz Angelica ^[1] ; Barco-Mendoza, Gabriel Amílcar ^[2] ; Rodriguez-Ramirez, Roberto ; Villanueva-Zayas, Jesus Daniel ^[2] ; Martínez-Porchas, Marcel ^[3] ; Villa-Lerma, Alma Guadalupe ^[2] ; Vallejo-Córdoba, Belinda ^[3] ; Delgado-Domínguez, Josué ^[2]
  1. [1] Universidad de Sonora

     Universidad de Sonora

     México

     
  2. [2] Instituto Tecnológico de Sonora

     Instituto Tecnológico de Sonora

     México

     
  3. [3] Coordinación de Tecnología de Alimentos de Origen Animal (CTAOA), Centro de Investigación en Ali-mentación y Desarrollo, A.C. (CIAD), CP. 83304, Hermosillo, Sonora, México

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• Localización: Biotecnia, ISSN 1665-1456, Vol. 26, Nº. 1, 2024 (Ejemplar dedicado a: January - December), págs. 59-67
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Monitoreo de la microbiota del hepatopáncreas asociada a genes de toxinas pirABVP en Penaeus vannamei: Monitoreo de la microbiota del hepatopáncreas
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    La producción acuícola de camarón se ha expandido rápidamente en las últimas décadas, convirtiéndose en una importante actividad económica a nivel mundial. Sin embargo, algunas infecciones bacterianas y virales son un gran desafío para esta actividad. La Necrosis Hepatopancreática Aguda (AHPND) es una enfermedad bacteriana que afecta a los estanques de granjas camaroneras y se presenta durante los primeros 30 días después de la siembra en estanques de camarones, causando una mortalidad del 70-100%. La microbiota tiene un papel importante en la producción del camarón y el control de enfermedades. En el presente estudio, los genes pirA y pirB fueron amplificados por PCR para confirmar tanto organismos positivos como negativos a AHPND en hepatopáncreas de camarones. Posteriormente se secuenciaron las regiones hipervariables ribosómicas (ARNr) V3-V4 del gen 16S utilizando la plataforma MiSeq. Los resultados demostraron una microbiota diversa en el grupo negativo a AHPND, compuesto principalmente por filos Proteobacteria, Firmicutes y Actinobacteria. Además, Proteobacteria fue el filo dominante en el hepatopáncreas infectado con AHPND, mientras que Firmicutes tendió a disminuir. Vibrio fue el género más abundante, prevaleciendo sobre algunos géneros como Corynebacterium, Weissella, Lactobacillus, Photobacterium y Geobacillus. Los resultados sugieren que la enfermedad de AHPND causa disbiosis en la microbiota hepatopancreática, y el filo Firmicutes podría requerir ser restaurado en dicho escenario.

  • English

    Shrimp aquaculture has rapidly expanded in the last decades, representing an important economic activity worldwide; however, bacterial, and viral infections are one of the biggest challenges in aquaculture activity. Acute Hepatopancreatic Necrosis Disease (AHPND) is a bacterial disease that affects shrimp farm ponds and occurs during the first 30 days after stocking in shrimp ponds, causing 70-100% mortalities. Microbiota has an important role in developing shrimp aquaculture and disease control. In the present study, pirA and pirB genes were amplified by PCR to confirm AHPND and non-AHPND in shrimp hepatopancreas; samples were sequenced using the MiSeq platform targeting the V3-V4 16S ribosomal (rRNA) hypervariable regions. Results demonstrated a diverse microbiota in the non-AHPND group, mainly composed of phyla Proteobacteria, Firmicutes, and Actinobacteria. Furthermore, Proteobacteria was the dominant phyla in the hepatopancreas infected with AHPND, while Firmicutes tended to decrease. Vibrio was the most abundant at the genus level, prevailing in some genera like Corynebacterium, Weissella, Lactobacillus, Photobacterium, and Geobacillus. Results suggest that AHPND causes dysbiosis in the hepatopancreatic microbiota, and the Firmicutes phylum could require to be restored under such scenario.