Resumen de Detección del gen xyl3 en cepas de Fusarium oxysporum f. sp. vanillae

Mauricio Luna Rodríguez, Nelly Abigail González Oviedo, Andrés Rivera Fernández, Felipe Robert Flores de la Rosa

• español

  Los mecanismos de Fusarium oxysporum relacionados con la degradación de componentes estructurales de la raíz, como el xilano, son muy importantes, dado que la colonización de este órgano es pieza clave en el establecimiento de la enfermedad. El presente estudio se enfocó en detectar el gen codificante para la enzima xilanasa xyl3 en cepas de F. oxysporum f. sp. vanillae y buscar homólogos a este gen en secuencias de otras formae speciales y especies del género Fusarium, con el fin de determinar las relaciones filogenéticas entre las xilanasas dentro del complejo de especies F. oxysporum, así como, buscar evidencia de selección natural en el año 2020. Los resultados indicaron que, de las nueve cepas evaluadas, solo tres tuvieron una copia del gen xyl3. La filogenia mostró ocho clados, donde el clado 3 fue consistente con la clasificación de xyl3, mientras que los otros tipos de xilanasas quedaron agrupados en el clado 2. La prueba de selección natural no mostró evidencia de selección positiva dentro de la filogenia, lo que sugiere que la mutación neutral es la responsable de la diversidad en el gen xilanasa entre el complejo de especies F. oxysporum, lo que lleva a proponer que el gen no parece haber cambiado con la colonización de nuevos hospedantes

• English

  The mechanisms of Fusarium oxysporum related to the degradation of structural components ofthe root, such as xylan, are very important since the colonization of this organ is a key piece inthe establishment of the disease. The present study focused on detecting the gene coding for thexylanase xyl3 enzyme in strains of F. oxysporum f. sp. vanillae and searching for homologues tothis gene in sequences of other formae speciales and species of the Fusarium genus, in orderto determine the phylogenetic relationships between xylanases within the F. oxysporum speciescomplex, as well as to search for evidence of natural selection. The results indicated that, ofthe nine strains evaluated, only three had a copy of the xyl3 gene. The phylogeny showed eightclades, where clade 3 was consistent with the classification of xyl3, while the other types ofxylanases were grouped in clade 2. The natural selection test showed no evidence of positiveselection within the phylogeny, suggesting that the neutral mutation is responsible for the diversityin the xylanase gene among the F. oxysporum species complex, leading to the proposal that thegene does not appear to have changed with colonization of new hosts.