Identificación fenotípica y molecular de Burkholderia spp en panículas de arroz (Oryza sativa L.)

• Autores: Dagne Valeria Fornos Reyes, Norvin Josué Peralta Herrera, Isaías Sánchez Gómez, Markelyn José Rodríguez Zamora
• Localización: La Calera, ISSN-e 1998-8850, Vol. 22, Nº. 39, 2022, págs. 134-139
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Fenotipic and molecular identification of Burkholderia spp in rice panicles (Oryza sativa L.)
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  • español

    La enfermedad conocida como Añublo bacteriano del arroz es causado por Burkholderia glumae, Burkholderia gladiolii y el Tizón de las plántulas de arroz causado por Burkholderia plantarii, son bacterias consideradas de importancia en el cultivo del arroz (Oryza sativa L.).  Las afectaciones han aumentado en los últimos años causando grandes pérdidas económicas anuales en los países productores de este grano. El objetivo de esta investigación fue identificar mediante pruebas fenotípicas y molecular, especies de Burkholderia en panículas de arroz (Oryza sativa L.). La colecta de muestras se realizó en el municipio de Sébaco, Matagalpa en el Centro experimental TAI-NIC y Finca Virginia, también en la empresa Agrícola Miramontes del departamento de Boaco y Finca la Doña, municipio de Malacatoya, Granada. Las bacterias fueron aisladas a partir de panículas con síntomas de la enfermedad y la identificación de especies se realizó mediante pruebas bioquímicas (diferenciación y carbohidratos). La confirmación de las especies de Burkholderia se realizó mediante la técnica molecular PCR (Reacción en cadena de la polimerasa). Los aislados de B. gladiolii en el medio King B presento colonias blancas grisáceas o amarillenta, produce el pigmento amarillo difuso no fluorescente, mientras B. plantarii mostraron colonias amarillas, traslucidas y convexas, no fluorescentes, para el caso de B. cepacia las colonias fueron traslucidas, convexas no fluorescentes. La identificación con pruebas bioquímicas demostró la presencia de 18 aislados positivos para B. gladiolii, dos aislados para B. plantarii y uno positivo a B. cepacia. Con la técnica PCR se identificaron 18 muestras positivas para B. gladiolii que amplificaron fragmentos de 479 pares de base y dos muestras positivas a B. plantarii con fragmentos de 597 pares de base, para el caso de B. glumae no fue identificada mediante prueba fenotípicas, ni molecular.

  • English

    The disease known as bacterial blight of rice is caused by Burkholderia glumae, Burkholderia gladiolii and the blight of rice seedlings caused by Burkholderia plantarii, are bacteria considered important in rice cultivation (Oryza sativa L.). The effects have increased in recent years causing large annual economic losses in the countries that produce this grain. The objective of this research was to identify, through phenotypic and molecular tests, Burkholderia species in rice panicles (Oryza sativa L.). The collection of samples was carried out in the municipality of Sébaco, Matagalpa in the TAI-NIC Experimental Center and farm Virginia, Agricola Miramontes in the department of Boaco and farm La Doña, municipality of Malacatoya, Granada. Bacteria were isolated from panicles with symptoms of the disease and species identification was performed by biochemical tests (carbohydrates and differentiation). Confirmation of the Burkholderia species was carried out using the molecular technique PCR (Polymerase Chain Reaction). The isolates of B. gladiolii in the King B medium presented grayish white or yellowish colonies, producing the non-fluorescent diffuse yellow pigment, while B. plantarii showed yellow, translucent, and convex, non-fluorescent colonies, in the case of B. cepacia colonies were translucent, convex, non-fluorescent. Identification with biochemical tests showed the presence of 18 positive isolates for B. gladiolii, two isolates for B. plantarii and one positive for B. cepacia. With the PCR technique, 18 positive samples were identified for B. gladiolii that amplified 479 bp fragments and two positive samples for B. plantarii with 597 bp fragments. In the case of B. glumae, it was not identified by phenotypic or molecular tests.