Metodologías para la detección de SARS-CoV-2 y análisis de carga viral mediante RT-PCR cuantitativa

• Jaquenod De Giusti, Carolina ^[1] ; Montanaro, Mauro ^[2] ; Mencucci, Maria Victoria ^[3] ; Canzoneri, Romina ^[4] ; Orlowski, Alejandro ^[1] ; Santana, Marianela ^[2] ; Pereyra, Erica ^[1] ; Kraemer, Mauricio ^[3] ; Lavarías, Sabrina María Luisa ^[5] ; Moscoso, Verónica ^[2] ; Costantini, Noelian ^[1] ; Francini, Flavio ^[3] ; Garda, Horacio ^[2] ; Pedríni, Nicolás ^[2] ; Gonzalez Baro, María ^[2] ; Vila Petroff, Martin ^[1] ; Aiello, Alejandro ^[1] ; Abba, Martin ^[4]
  1. [1] Centro de Investigaciones Cardiovasculares (CIC-CONICET-UNLP)
  2. [2] Instituto de Investigaciones Bioquímicas La Plata (INIBIOLP-CONICET-UNLP)
  3. [3] Centro de Endocrinología Experimental y Aplicada (CENEXA-CONICET-UNLP)
  4. [4] Centro de Investigaciones Inmunológicas Básicas y Aplicadas (CINIBA-UNLP)
  5. [5] Instituto de Limnología de La Plata (ILPLA-CONICET-UNLP)

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• Localización: Innovación y Desarrollo Tecnológico y Social (IDTS), ISSN-e 2683-8559, Vol. 2, Nº. Extra 2, 2020 (Ejemplar dedicado a: Número especial COVID-19), págs. 1-14
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • SARS-CoV-2 diagnosis and viral load methods based on quantitative RT-PCR
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    En diciembre de 2019, se produjo un nuevo brote de enfermedad por coronavirus (COVID-19) en Wuhan, China. El síndrome respiratorio agudo severo-coronavirus-2 (SARS-CoV-2), que es el séptimo coronavirus conocido que infecta a los humanos, es altamente infeccioso y se ha expandido rápidamente en todo el mundo desde su descubrimiento. El diagnóstico de la infección por SARS-CoV-2 se basa en la detección del genoma viral (ARN) a través de técnicas de biología molecular. Con este fin, se extrae el ARN total para su posterior detección mediante PCR cuantitativa en tiempo real (RT-qPCR). Las pruebas cuantitativas de ácidos nucleicos se han convertido en el “estándar de oro” para el diagnóstico y guía en la toma de decisiones clínicas. Sin embargo, los ensayos de RT-qPCR dirigidos al SARS-CoV-2 tienen varios desafíos, especialmente en términos de diseño de cebadores / sondas y de desarrollo de metodologías que permitan estimar la carga viral en pacientes con diagnóstico de COVID-19.

  • English

    In December 2019, a new coronavirus disease (COVID-19) outbreak occurred in Wuhan, China. Severe acute respiratory syndrome-coronavirus-2 (SARS-CoV-2), which is the seventh coronavirus known to infect humans, is highly contagious and has rapidly expanded worldwide since its discovery. Quantitative nucleic acid testing has become the gold standard for diagnosis and guiding clinical decisions regarding the use of antiviral therapy. Total RNA is purified for subsequent SARS-CoV-2 detection by a real time quantitative RT-PCR (RT-qPCR). However, the RT-qPCR assays targeting SARS-CoV-2 have a number of challenges, especially in terms of primer / probe design and in the development of methodologies to estimate viral load in patients diagnosed with COVID-19.