Evaluation of non-invasive oral sampling versus nasopharyngeal swab for RTq-PCR detection of SARS-CoV-2 RNA

• José Cherem ^[1] ; Ingrid Marciano Alvarenga ^[1] ; Denise Alvarenga Rocha ^[1] ; Karla Silva Teixeira Souza ; Joseane Camilla de Castro ^[1] ; Lucas Abrahão Daher Pacheco ^[1] ; Pedro Henryque de Castro ^[1] ; Sidney de Almeida Ferreira ^[1] ; Ana Paula Peconick ^[2] ; Victor Satler Pylro ^[1] ; Joziana Muniz de Paiva Barçante ^[1]
  1. [1] Universidade Federal de Lavras

     Universidade Federal de Lavras

     Brasil

     
  2. [2] Universidade Federal de Viçosa

     Universidade Federal de Viçosa

     Brasil

     
• Localización: Cuadernos de Educación y Desarrollo, ISSN-e 1989-4155, Vol. 15, Nº. 1, 2023, págs. 38-52
• Idioma: inglés
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• Resumen
  • English

    The global spread of SARS-CoV-2 has resulted in a public health crisis and major economic impact, with millions of confirmed cases and deaths worldwide. An important aspect of controlling the spread of the virus is testing individuals for COVID-19. Currently, the gold standard is the association of RT-qPCR with the Nasopharyngeal Swab (Ns), which is uncomfortable and requires specialized personnel for sample collection. Mass testing, unprecedented in human history, leads to the search for innovations and facilities in the methodology, but which maintains diagnostic security, even in the face of new variants of the virus. This study aimed to evaluate a less invasive alternative method, collecting samples from the oral mucosa with a swab (Os). For comparison,the same patients were tested using biological material collected through Os and Ns. Samples were processed and analyzed by RTq-PCR. Results showed 100% concordance between Ns and Os samples from elderly patients, and SARS-CoV-2 was detected in saliva samples up to 14 days after the onset of symptoms in 31.25% of hospitalized patients. Our data and conclusion provide an important base for uture studies of standardization and validation of the procedure described here. Using a more comfortable method couldincrease population adherence to testing and contribute to controlling the transmission of COVID-19.

  • português

    A disseminação global do SARS-CoV-2 resultou em uma crise de saúde pública e grande impacto econômico, com milhões de casos confirmados e mortes em todo o mundo. Um aspecto importante do controle da propagação do vírus é testar indivíduos para COVID-19. Atualmente, o padrão ouro é a associação de RT-qPCR com Swab Nasofaríngeo (Ns), que é desconfortável e requer pessoal especializado para coleta de amostras. A testagem em massa, inédita na história da humanidade, leva à busca de inovações e facilidades na metodologia, mas que mantém a segurança diagnóstica, mesmo diante de novas variantes do vírus.Este estudo teve como objetivo avaliar um método alternativo menos invasivo, coletando amostras da mucosa oral com um swab (Os). Para comparação, os mesmos pacientes foram testados usando material biológico coletado por meio do Os e do Ns. As amostras foram processadas e analisadas por RTq-PCR. Os resultados mostraram 100% de concordância entre as amostras de Ns e Os de pacientes idosos. Nossos dados e conclusões fornecem uma base importante para futuros estudos de padronização e validação do procedimento aqui descrito. A utilização de um método mais confortável pode aumentar a adesão da população à testagem e contribuir para o controle da transmissão do SARS-CoV-2 e de outros vírus respiratórios.