Exploración genómica para identificar mutaciones somáticas en plantas de la variedad Berués ("Vitis vinifera L.")

• M. Espinal ^[1] ; M. Alfaro ^[1] ; S. Crespo-Martínez ^[1] ; C. Miranda ^[1] ; L.G. Santesteban ^[1] ; J. Urrestarazu ^[1]
  1. [1] Universidad Pública de Navarra

     Universidad Pública de Navarra

     Pamplona, España

     
• Localización: IV Jornadas del Grupo de Viticultura: Acta de Horticultura : Comunicaciones Técnicas Sociedad Española de Ciencias Hortícolas : 26-28 de octubre 2022, Pamplona/Iruña / coord. por Luis Gonzaga Santesteban García, Nazareth Torres Molina, 2022, ISBN 978-84-09-38456-3, págs. 49-53
• Idioma: español
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• Resumen

  • La disponibilidad de tecnologías de secuenciación de nueva generación (NGS), encombinación con genomas de referencia de calidad, permite identificar mutacionessomáticas entre plantas de variedades de especies que, como la vid, se reproducenvegetativamente desde hace siglos. El objetivo de este trabajo es a partir de datos NGSconocer el nivel de variabilidad intravarietal entre plantas de Berués recientementerecuperadas en la Cuenca de Pamplona. Mediante el uso de recursos computacionalesde acceso abierto disponibles en la plataforma Galaxy se diseñó un flujo de trabajoque permitió identificar, por una parte, las variantes comunes entre las plantassecuenciadas frente al genoma de referencia y, por otra, las variantes únicas(polimorfismos presentes sólo en un individuo), así como las variantes compartidas porcuatro, tres o dos plantas de Berués analizadas. Este estudio constituye el punto departida para identificar qué variantes podrían ser responsables de la variaciónfenotípica observada entre plantas de esta variedad, así como para conocer losindividuos de Berués que a nivel genómico pueden estar más próximos.