Estimación de la diversidad genética y del tamaño efectivo de la población de coquina Donax trunculus del Parque Nacional de Doñana y su contribución a áreas no protegidas

• Ciro Rico ^[1] ; Pilar Drake ^[2] ; Enrique Macpherson ^[2] ; José A. Cuesta ^[2]
  1. [1] University of South Pacific
  2. [2] CSIC
• Localización: Proyectos de investigación en parques nacionales: 2011-2014 / coord. por Organismo Autónomo Parques Nacionales (España), 2016, ISBN 978-84-8014-898-6, págs. 177-192
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Estimation of the genetic diversity and effective size of the population of thewedge clam donax trunculus of the Doñana National Park and its contribution to unprotected areas
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    Se han estudiado ejemplares de coquina, Donax trunculus en 7 localidades distribuidas por las costaspeninsulares atlánticas y mediterráneas españolas. Se ha hecho un análisis comparado de datos de tallasy densidad obtenidos en una localidad explotada (Isla Canela) y otra protegida (playa del Parque Nacional de Doñana), que muestran que la gestión llevada a cabo en el Parque Nacional Doñana es la correcta y permite una pesca sostenible. Se aislaron y caracterizaron 21 loci de microsatélites de los cuales16 resultaron polimórficos y codominantes. De ellos al menos 12 presentan elevadas frecuencias de alelos nulos en todas las poblaciones, y el resto en la mayoría de poblaciones. Todas las muestras fuerongenotipadas con estos 16 loci y se determinaron los índices de diversidad genética, pruebas de equilibrio,índices de fijación y las probabilidades de diferenciación entre localidades. También se determinaronlas probabilidades de asignación a la localidad de muestreo. Se realizaron diversos análisis para determinar las causas potenciales de las desviaciones del equilibrio de Hardy-Weinberg y se demostró quese deben principalmente a alelos nulos. Se descubrió mediante el análisis del marcador ribosomal ITSque las poblaciones de coquina explotadas comercialmente en España bajo la denominación específicaDonax trunculus son en realidad una mezcla de una especie híbrida y una no híbrida. El análisis de laestructura genética, tanto el realizado a todos los individuos como de forma separada para individuoshíbridos y no-híbridos, demostró que existen cuatro poblaciones genéticamente distintas en el litoralespañol. La primera en el Mar Cantábrico, la segunda en el Golfo de Cádiz, la tercera entre el Estrechode Gibraltar y el Cabo de Gata y la última entre el Cabo de Gata y el Golfo de Rosas.

  • English

    We have studied seven populations of the wedge clam Donax trunculus, distributed throught the Spanish Atlantic and Mediterranean coasts. A comparative analysis of size and density was performedfrom a sample obtained from a commercially exploited population from Isla Canela, and from anotherpopulation which is managed under a strict plan using only artisanal hand dredging from the beach ofthe Doñana National Park showing that the management carried out in the Doñana National Park iscorrect and allows sustainable fisheries. Twenty one microsatellite loci were isolated and characterizedin D. trunculus of which 16 were polymorphic and codominant. At least 12 of them have high frequencies of null alleles in all populations, and the rest in most populations. All collected samples were genotyped with these 16 loci and genetic diversity indices, tests of disequiibrium, fixation indices andprobabilities of genetic differentiation among localities were determined. The odds of assignment tothe sampling location were also determined. Several analyses were conducted to determine the potentialcauses for the deviations from Hardy-Weinberg equilibrium which shown that they were mainly dueto the presence of null alleles. Furthermore, using the ribosomal internal transcribed spacer it was determined that the commercially exploited populations of the wedge clam under the specific name Donaxtrunculus are actually a mixture of a hybrid and non-hybrid species. The analysis of the genetic structuremade both to all individuals and separately for hybrid and non-hybrid individuals showed four genetically distinct populations in the Spanish coast. The first in the Cantabric Sea, the second in the Gulfof Cadiz, the third from the Strait of Gibraltar to Cabo de Gata and the last one from the Cabo de Gatato the Gulf of Rosas.