Variabilidad del marcador genético CLOCK rs3749474 y su impacto en la investigación y ensayos clínicos sobre obesidad y ritmo circadiano

• Ángel Roco-Videla ^[1] ; Sergio V. Flores ^[2] ; Mariela Olguín-Barraza ^[3] ; Nelson Maureira Carsalade ^[4]
  1. [1] Universidad de las Américas

     Universidad de las Américas

     Santiago, Chile

     
  2. [2] Universidad Autónoma de Chile

     Universidad Autónoma de Chile

     Temuco, Chile

     
  3. [3] Universidad Bernardo O'Higgins

     Universidad Bernardo O'Higgins

     Santiago, Chile

     
  4. [4] Universidad Católica de la Santísima Concepción

     Universidad Católica de la Santísima Concepción

     Comuna de Concepción, Chile

     

  Mostrar afiliaciones +
• Localización: Nutrición hospitalaria: Órgano oficial de la Sociedad Española de Nutrición Clínica y Metabolismo (SENPE), ISSN-e 1699-5198, ISSN 0212-1611, Vol. 39, Nº. 5 (Septiembre-Octubre), 2022, págs. 1117-1121
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Variability of the genetic marker CLOCK rs3749474 and its impact on research and clinical trials on obesity and circadian rhythm
• Texto completo no disponible (Saber más ...)
• Resumen
  • español

    Introducción: los ritmos circadianos influyen en la conducta alimentaria, siendo el gen CLOCK uno de los encargados de su regulación. El rs3749474T/C del gen CLOCK ha sido asociado a un mayor riesgo de obesidad y quienes portan el alelo T presentan una mayor pérdida de peso ante una dieta baja en carbohidratos y lípidos que quienes poseen la forma CC.

    Material y métodos: usando la base de datos 1000 Genomes se obtuvo el genotipo del polimorfismo de nucleótido único (SNP) rs3749474 de 2.504 individuos, abarcando cinco macropoblaciones (África, Este Asiático, Sur Asiático, Europa y Latinoamérica) y 26 poblaciones. CT y TT fueron tratados como genotipos de no riesgo y CC, como de riesgo. Se utilizó la prueba exacta de Fisher para comparar las frecuencias de los genotipos de riesgo y no riesgo.

    Resultados: existe una alta diferenciación para la frecuencia de genotipos portadores del alelo T entre las macropoblaciones: África alcanzó solo el 31,47 %; Europa, un 56,86 %; Latinoamérica, un 66,28 %; el Sur Asiático, un 68,3 %; y el Este Asiático, un 81,15 %, con diferencias significativas (pFisher < 0,05) en todas las comparaciones, excepto entre Latinoamérica y Sur Asiático. Se observó una baja heterogeneidad entre poblaciones dentro de cada macropoblación.

    Conclusiones: la alta heterogeneidad para las frecuencias genotípicas de CLOCK rs3749474 en las macropoblaciones estudiadas indica que la disminución del consumo de carbohidratos y lípidos tendrá un impacto heterogéneo desde el punto de vista epidemiológico. Esto sugiere incluir la ancestría genética en posteriores estudios de asociación entre ciclos circadianos, conducta alimentaria y obesidad, con el objeto de desarrollar pruebas clínicas personalizadas.

  • English

    Introduction: circadian rhythms influence eating behavior, with the CLOCK gene being one of those responsible for its regulation. The rs3749474T/C of the CLOCK gene has been associated with an increased risk of obesity. Those who carry the T allele have greater weight loss on a diet low in carbohydrates and lipids than those who have the CC form.

    Methodology: using the 1000 Genomes database, the genotype of the single nucleotide polymorphism (SNP) rs3749474 was obtained from 2,504 individuals, covering five macro-populations (Africa, East Asia, South Asia, Europe and Latin America) and 26 populations. CT and TT were treated as non-risk genotypes and CC as risk. Fisher’s exact test was used to compare the frequencies of risk and non-risk genotypes among the five macro populations.

    Results: there is a high differentiation for the frequency of genotypes carrying the T allele among the macro-populations: Africa reached only 31.47 %, Europe 56.86 %; Latin America 66.28 %; South Asia 68.3 % and East Asia 81.15 %, with significant differences (p Fisher < 0.05) in all comparisons, except between Latin America and South Asia. Low heterogeneity was observed between populations within each macro population.

    Conclusions: the high heterogeneity for the genotypic frequencies of CLOCK rs3749474 in the studied macro-populations indicates that the decrease in the consumption of carbohydrates and lipids will have a heterogeneous impact, from the epidemiological point of view. This suggests including the genetic ancestry in later studies of association between circadian cycles, eating behavior and obesity, in order to develop personalized clinical tests.