Editor de ecuaciones para la plataforma de simulación de sistemas biológicos

• Autores: Gilberto Arias Naranjo
• Localización: Serie Científica de la Universidad de las Ciencias Informáticas, ISSN-e 2306-2495, Vol. 2, Nº. 1, 2009, págs. 1-9
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Equation editor for the biological systems simulation platform
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• Resumen
  • español

    El surgimiento de la Biología de Sistemas introdujo el uso de herramientas computacionales en el estudio y modelación desistemas biológicos. Una de estas herramientas es la plataforma de simulación de sistemas biológicos BioSyS, la cual realizaexploraciones intensivas en modelos de sistemas biológicos y permite realizar meta análisis sobre los resultados que estasexploraciones arrojan. En este trabajo se presenta un software que se integra a la plataforma BioSyS y permite la edición desistemas de ecuaciones a través de una interfaz amigable que representa las expresiones mediante una notación simbólica. Laherramienta cuenta además con una biblioteca de expresiones dando la posibilidad al usuario de conservar los fragmentos defórmulas que más utiliza, exporta a diferentes formatos, incluido el estándar de representación matemática MathML y brindamecanismos para analizar la homogeneidad dimensional de las ecuaciones escritas ayudando así a los investigadores en larevisión de las mismas.

  • English

    The emergence of Systems Biology introduced the use of computational tools in the study and modeling of biological systems.One of these tools is the platform simulation of biological systems BioSyS, which conducts intensive explorations over models ofbiological systems and allows meta-analysis on the results. This paper presents a software that is integrated into the platformBioSyS and allows editing equations systems through a user-friendly interface that represents expressions via a symbolicnotation. The software also includes a library of expressions giving the user the ability to retain fragments of formulas commonlyused, exports to different formats, including standard mathematical representation MathML and provides mechanisms to analyzedimensional homogeneity of equations written, helping investigators reviewing them.