Componente para análisis estadísticos de coeficientes de endogamia para la solución informática SEEGEN-R

• Autores: Ernesto Alfredo Molina Suárez, Dayana Joseph Smarth, Dayana Mendoza Peña, Bernardo Hernández González
• Localización: Serie Científica de la Universidad de las Ciencias Informáticas, ISSN-e 2306-2495, Vol. 10, Nº. 2, 2017, págs. 18-28
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Component for statistical analysis of inbreeding coefficients for the SEEGEN-R computing solution
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• Resumen
  • español

    En el Centro Nacional de Genética Médica (CNGM), se realizan los cálculos estadísticos de los estudios deEpidemiología Genética utilizando el Sistema Estadístico de Epidemiología Genética – basado en R (SEEGEN-R),herramienta desarrollada en la Universidad de las Ciencias Informáticas (UCI) que contiene módulos para larealización de estudios de Genética Poblacional, Epidemiología Tradicional y Epidemiología Genética. Actualmente, en el CNGM, se realizan análisis estadísticos de los coeficientes de endogamia de la población, pero SEEGEN-R no contiene las funciones necesarias para la realización de los mismos. El objetivo de la presente investigación es desarrollar un componente que permita la integración de los estudios de coeficientes de endogamia para su uso por los especialistas del CNGM. Se utiliza Java como lenguaje de programación para manejar la presentación de los análisis a los usuarios y R como motor de cálculo de las funciones estadísticas. En este componente se utilizó RUP como metodología de desarrollo, Netbeans como entorno de desarrollo integrado y la librería de clases RServe para comunicar los lenguajes de programación utilizados. Como resultado se obtuvo un componente, que satisface las necesidades del CNGM, para realizar los estudios de coeficientes de endogamia en la solución informática SEEGENR.

  • English

    The National Centre for Medical Genetic (CNGM), perform statistical calculations of the studies of geneticepidemiology using the Statistical System of Genetic Epidemiology – R based (SEEGEN-R), tool developed at theUniversity of Informatics Sciences (UCI) that contains modules for studies of population genetics, traditionalepidemiology and genetic epidemiology. Currently, in the CNGM, statistical analysis of the inbreeding coefficients inthe population are made, but SEEGEN-R does not contain the functions required for the realization of the same. Theobjective of this research is to develop a component that allows the integration of studies of inbreeding coefficientsfor use by the CNGM specialists. Is used Java as a programming language to manage the presentation of the analysesto the users and R as an engine for calculation of statistical functions. RUP as methodology development, Netbeansas IDE and RServe library was used in this component to communicate the used programming languages. Wasobtained as result a component, which meets the needs of the CNGM to make studies of inbreeding coefficients in thesoftware SEEGEN-R.