Mapas genéticos en acuicultura

• C. Bouza ^[1] ; P. Martínez ^[1]
  1. [1] Universidade de Santiago. Departamento de Zooloxía, Xenética e Antropoloxía Física
• Localización: Genética y genómica en acuicultura / coord. por Paulino Martínez Portela, Antonio Figueras Huerta, 2009, págs. 311-357
• Idioma: español
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• Resumen
  • español

    El mapeo genético representa un primer nivel de análisis estructuraldel genoma. Permite establecer diagramas lineales de los cromosomasde una especie, localizando la posición relativa de distintos elementosgenéticos anónimos o funcionales, incluyendo genes. Los mapas genéticos representan una primera aproximación para la identificación de mutantes o genes de interés, y, en último término, para su caracterización molecular y funcional. Son, por tanto, herramientas de investigación esenciales en producción animal y vegetal, para estudiar la base genética de enfermedades y caracteres productivos de interés. Además, el análisis de ligamiento proporciona mapas de referencia para desarrollar o completar mapas físicos y proyectos genoma. La relación entre mapas físicos y genéticos no es siempre lineal debido a la existencia de entrecruzamientos múltiples y a la variación de la probabilidad de entrecruzamiento a lo largo del cromosoma. Para solventar este problema, se han propuesto diferentes funciones de mapa con distintas asunciones sobre el nivel de interferencia cromosómica. En este contexto, cobra especial importancia la localización de los centrómeros, ya que limitan la probabilidad de entrecruzamiento en su proximidad.En organismos acuáticos, el posicionamiento de estas estructurascromosómicas se realiza mediante el análisis de medias tétradas uti-lizando ginogenéticos diploides. Además este análisis, proporcionauna herramienta más potente para asociar mutantes y marcadores agrupos de ligamiento, para evaluar la existencia de ligamiento entrepares de marcadores o para estudiar el patrón de entrecruzamientosa lo largo del eje cromosómico mediante el análisis de segregaciónconjunta. El conocimiento preciso de las tasas de recombinación entresexos, regiones cromosómicas y familias, tiene gran relevancia prácticapara el diseño experimental en las especies objeto de análisis genómi-co. En este artículo se revisan los principales aspectos metodológicosen la construcción de mapas de ligamiento, haciendo énfasis en losdatos disponibles en organismos acuáticos. Asimismo, se presentan lasprincipales aplicaciones del mapeo genético para estudios evolutivos yaplicados para la mejora de la producción en acuicultura.

  • English

    Genetic mapping represents a first level of the structural genomic analysis. It enables to establish a diagram of the chromosomes of a speciesshowing the relative position of anonymous and functional genetic elements,including genes. Genetic maps represent a first approach for identifying andisolating mutants or relevant genes, and lastly to ascertain their molecularand functional properties. They are essential for animal and plant produc-tion to find out the genetic basis of diseases and other productive traits. Inaddition, linkage analysis provides the framework maps which are essentialas reference for developing and completing physical maps and genomicprojects. The relationship between physical and genetic maps is not alwayslinear due to the existence of multiple cross-overs and to the variation ofchiasma probability along chromosomes. Different mapping functions havebeen proposed to solve this problem, with different assumptions about thelevel of chromosomal interference. In this context, localizing centromeresappears as a relevant task, since they reduce cross-over probability in their vicinity. In aquatic organisms, locating centromeres is accomplished throughhalf-tetrad analysis using diploid gynogenetic progenies. Additionally, thisanalysis provides a powerful tool to associate mutants or genetic markers tolinkage groups, to evaluate the existence of linkage between pairs of markers,or to obtain a detailed picture of cross-over pattern across chromosomesthrough joint segregation analysis. Knowledge of the rates of recombinationdependent on sex, chromosomal region or family has substantial practicalsignificance for experimental design and genomic analysis in the speciesof interest. In this paper, we present a review of the main methodologicalaspects involved in map construction, with particular emphasis in availabledata from aquatic organisms. In the same way, the main applications ofgenetic mapping in evolutionary and applied studies for production impro-vement of aquaculture are presented.