Acoplamiento molecular sobre la proteína dUTPasa de Trypanosoma cruzi para el descubrimiento de inhibidores en el tratamiento de la enfermedad de Chagas

• Torres Lemus, John Alexander ^[1] ; Rojas Rojas, Angela Patricia ^[1] ; López Vallejo, Fabian ^[1]
  1. [1] Universidad Nacional de Colombia

     Universidad Nacional de Colombia

     Colombia

     
• Localización: Revista Colombiana de Ciencias Químico-Farmacéuticas, ISSN-e 1909-6356, ISSN 0034-7418, Vol. 50, Nº. 3, 2021 (Ejemplar dedicado a: 50(3))
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Docking molecular da dUTPase do Trypanosoma cruzi para identificação de inibidores no tratamento da doença de Chagas
  • Molecular docking of the Trypanosoma cruzi dUTPase for identification of inhibitors in Chagas disease treatment
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• Resumen
  • español

    Introducción: la enfermedad de Chagas es endémica de las zonas tropicales deAmérica Latina y presenta una importante prevalencia, sin embargo, existen pocostratamientos disponibles en el mercado por lo que la búsqueda de moléculas conpotencial farmacológico que actúen en el parásito Trypanosoma cruzi, causante de laenfermedad, es necesaria considerando las graves complicaciones. Objetivo: evaluarlas potenciales proteínas blanco, disponibles en la base de datos de PDB considerandocomo parámetro inicial, la similitud con proteínas humanas e identificarpotenciales inhibidores del blanco elegido por medio de acoplamiento molecular.Metodología: se realizó una evaluación de las proteínas del parásito por medio dealineamiento de secuencias y posteriormente un cribado virtual por acoplamientomolecular con bases de datos y recursos informáticos disponibles en el Centro deCómputo Avanzado de la Universidad de Texas (TACC), y se evaluaron los mejoresresultados en función de afinidad, farmacocinética y toxicidad. Resultados: el blanco molecular elegido fue la dUTPasa. Posterior al cribado virtual se seleccionaron12 moléculas que presentan potencial inhibidor de estas, la 4-{3-[3-(trifluorometil)fenil]isoxazol-5-il}pirimidin-2-amina es una de las moléculas con mejor perfilpara convertirse en candidato en el tratamiento de la enfermedad de Chagas.

  • English

    Introduction: Chagas disease is endemic to the tropical areas of Latin Americaand has an important prevalence, however, there are few treatments available in themarket, so the search for molecules with pharmacological potential that can act inthe same way as the disease, it is necessary considering the serious complications.Aim: to evaluate the possible target proteins available in the PDB database, consideringthe similarity with human proteins as an initial parameter and identify potentialinhibitors of the chosen target using molecular docking. Methodology: an evaluationof the parasite proteins was carried out by means of sequence alignment andsubsequently a virtual molecular coupling screening was performed with databasesand computer resources available at Centro de Cómputo Avanzado de Universidadde Texas (TACC), and the best results were evaluated based on affinity, pharmacokinetics,and toxicity. Results: the molecular target chosen was the dUTPase. Aftervirtual screening, 12 moles showing inhibitory potential were selected of these, 4- {3-[3- (trifluoromethyl) phenyl] isoxazole-5-yl} pyrimidine-2-amine is one of the moleculeswith the best profile to become a candidate in the treatment of Chagas disease.

  • português

    Introdução: a doença de Chagas é endêmica das áreas tropicais da América Latinae possui importante prevalência, porém, poucos são os tratamentos disponíveis nomercado, por isso a busca por moléculas com potencial farmacológico que possam atuar da mesma forma que a doença, é necessário considerando as complicações graves.Objetivo: avaliar as possíveis proteínas-alvo disponíveis na base de dados do PDB,considerando a similaridade com proteínas humanas como parâmetro inicial e identificaçãode potenciais inibidores do alvo escolhido por meio de acoplamento molecular..Metodologia: uma avaliação das proteínas do parasita foi realizada por meiode alinhamento de sequências e posteriormente foi realizada uma triagem de acoplamentomolecular virtual com bancos de dados e recursos computacionais disponíveisno Centro de Cómputo Avanzado de Universidad de Texas (TACC), e os melhoresresultados foram avaliados com base na afinidade, farmacocinética e toxicidade. Resultados:o alvo molecular escolhido foi a dUTPase. Após a triagem virtual, 12 molesmostrando potencial inibitório foram selecionados destes, 4- {3- [3- (trifluorometil)fenil] isoxazol-5-il} pirimidina-2-amina é uma das moléculas com o melhor perfil parase tornar um candidato no tratamento da doença de Chagas.