Resumen de Relaciones filogenéticas del Criollo argentino con otros bovinos Criollos de América Latina según lo reveladopor un microarreglo de polimorfismos de nucleótido simple de mediana densidad

Maria Agustina Raschia, Mario Poli

• español

  La historia demográfica del bovino Criollo en Argentina y en América Latina en general se remonta a la época dela colonización española. El objetivo de este estudio fue investigar el uso potencial de un microarreglo de SNP demediana densidadpara describir animales de los rodeos más representativos y antiguos en el tiempo en que seconstituyó la Asociación Argentina de Criadores de Ganado Bovino Criollo y explorar la relación filogenética conotros bovinos criollos de Latinoamérica. Con los genotipos de 51 animales en 34 008 SNP autosómicos se generaronmatrices de distancias genéticas basadas en la proporción de alelos idénticos por estado compartidos entre animalesy entre animales agrupados según su origen, con el programa PLINK. Se construyó un árbol filogenético basado endistancias genéticas entre pares de animales usando PHYLIP, y se preparó para su visualización con FigTree. Serealizó unanálisis de escalamiento multidimensional para evaluar la relaciónentérminos de distancia genéticaentre los diferentes grupos de animales. Las distancias genéticas entre animales variaronde 0.186a0.357alconsiderar todos los pares de animales, y de 0.186 a 0.338 al considerar pares de criollos. El dendrograma obtenidopresentó tres agrupamientos. El grupo 1 incluyó ganado criollo de Colombia, Guadalupe, Paraguay y Uruguay, ylos grupos de referencia HolandoyJersey. El grupo2 comprendióexclusivamente ganadocriollopatagónico,mientras que el tercer grupo incluyó los restantes criollos argentinos. Los patrones de relación genética obtenidos através del escalamiento multidimensional demostraronuna íntima relaciónentre criollos de cuatro orígenes deArgentina. Estopuede explicarse enparte por lamigracióntempranade animales que originaronlos rodeos undadores en algunas localidades argentinas. Los resultados de este estudio contribuirán a una mejor comprensiónde la formación de los rodeos fundadores de criollos en Argentina y de la relación con otras poblaciones de ganadocriollo de América Latina.

• English

  The demographic history of Creole cattle in Argentina and in Latin America dates back to the time of the Spanishcolonization. This study aimed to investigate the potential use of a mediumdensity SNP array to describe cattlefromthe most representative andoldest herds of the Argentine Creole cattle breedregisteredat the time of theconstitution of the Argentinean Creole Cattle Breeders Association and to explore the phylogenetic relationship withCreole cattle fromother LatinAmericancountries. Toachieve this goal, genotypes from51 animals on34,008autosomal SNP were used to generate genetic distance matrices based on the proportion of shared identicalbystatealleles among individual animals and animals clustered according to their origin, analyzed by the PLINKprogram.Aneighborjoining phylogenetic tree based on pairwise genetic distance was constructed using PHYLIP and wasprepared for visualization using FigTree. Amultidimensional scaling analysis was performed to evaluate the levelof relationship in terms of genetic distance among the different animal clusters. Genetic distances between animalsvaried from0.186 to 0.357 when considering all pairs of animals, and from0.186 to 0.338 when considering Creolepairs. The dendrogramobtained showed three major clusters. Cluster 1 included Latin American Creole cattle fromColombia, Guadalupe, Paraguay, and Uruguay, and the reference groups of Holstein and Jersey cattle. Cluster 2contained exclusively Patagonian Creole cattle, while the third cluster included the remaining Argentinean Creoles.The genetic relationship patterns obtainedvia multidimensional scaling showeda close relationship among fourgroups of Creole animals fromArgentina. The closeness between clusters can be explained in part on the basis ofearly migration of animals that gave rise to founders herds at some Argentinean locations. The outcomes of thisstudycontribute toabetter understandingof the compositionof the earlyfounder herds of Creole cattle inArgentina and the relationship with other Latin America Creole cattle populations.