Resumen de Empleo de la reacción en cadena de la polimerasa en la detección del SARS-CoV-2

Jjosé Francisco Cancino Mesa, Adrián A. Vitón Castillo, Jorge Casí Torres

• español

  Introducción: la reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa es una técnica de alta precisión en la detección y amplificación de material genético, y por ende en la detección de virus.

  Objetivo: describir las bases del empleo de la reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa como prueba diagnóstica en la detección del SARS-CoV-2.

  Método: se realizó una revisión de la literatura en artículos publicados hasta mayo de 2020. Se consultaron las bases de datos: Scopus, Wiley Online Library, SciELO, DIALNET, EBSCO, MEDLINE y PubMed. Se recuperaron artículos en español e inglés, seleccionándose 43 referencias.

  Desarrollo: la reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa para detectar SARS-CoV-2 consiste en la lectura de la ARN polimerasa dependiente del ARN, fragmentos ORF1ab, el gen E, el gen N y el gen S. El exudado nasofaríngeo ofrece mejores resultados que el orofaríngeo y saliva como muestra. Resulta necesaria la inclusión de pruebas reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa que utilicen especímenes de hisopado rectal en casos sospechosos falsos negativos. Nuevos estudios y técnicas se elaboran con el objetivo de optimizar el proceso de detección.

  Conclusiones: la disponibilidad de pruebas diagnósticas es crucial para el aislamiento de casos positivos y el seguimiento de la cadena epidemiológica de transmisión. La RT-PCR resultó ser la prueba de elección durante el período de replicación viral. El ensayo RT-LAMP es una alternativa diagnóstica rápida con principios similares a la RT-PCR.

• English

  Introduction: the reverse transcriptase polymerase chain reaction is a highly precise technique in the detection and amplification of genetic material, and therefore in the detection of viruses.

  Objective: to describe the bases of the use of the polymerase chain reaction with reverse transcriptase as a diagnostic test in the detection of SARS-CoV-2.

  Method: a literature review was carried out on articles published up to May 2020. The following databases were consulted: Scopus, Wiley Online Library, SciELO, DIALNET, EBSCO, MEDLINE and PubMed. Articles in Spanish and English were retrieved, selecting 43 references.

  Development: The reverse transcriptase polymerase chain reaction to detect SARS-CoV-2 consists of reading RNA-dependent RNA polymerase, ORF1ab fragments, the E gene, the N gene, and the S gene.

  The nasopharyngeal exudate offers better results than oropharyngeal and saliva as sample. The inclusion of reverse transcriptase polymerase chain reaction tests using rectal swab specimens is necessary in suspected false negative cases. New studies and techniques are developed with the aim of optimizing the detection process.

  Conclusions: the availability of diagnostic tests is crucial for the isolation of positive cases and the monitoring of the epidemiological chain of transmission. RT-PCR turned out to be the test of choice during the viral replication period. The RT-LAMP assay is a rapid diagnostic alternative with similar principles to RT-PCR.