Temporal and vertical variability of bacterioplankton composition in Chipana bay (21º20’S) in a coastal upwelling system of northern Chile: A fluorescence in situ hybridization approach

• Autores: Cristy Medina Armijo, Rubén Moraga Mamani, Edgardo Santander Pulgar
• Localización: Revista de biología marina y oceanografía, ISSN 0718-1957, ISSN-e 0717-3326, Vol. 55, Nº. 1, 2020, págs. 47-58
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Variabilidad temporal y vertical del bacterioplancton en bahía Chipana (21º20’S) en un sistema de surgencia costera del norte de Chile: Una aproximación mediante hibridación in situ fluorescente
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    Resumen: Se estudió, mediante visualización y enumeración con la técnica de hibridación fluorescente in situ (FISH), el bacterioplancton en un sistema de surgencia asociado con una zona de mínimos de oxígeno (ZMO), en el Pacífico Sur Oriental. Se evaluaron 6 grupos taxonómicos diferentes (Alfa, Beta, Gamma-proteobacteria, Cytophaga-flavobacterium y el dominio Archaea y Bacteria). El análisis mostró una mayor abundancia del dominio Bacteria (20 a 68% de células hibridadas) sobre el dominio Archaea (2 a 18% de células hibridadas). Los grupos específicos mostraron que Cytophaga-flavobacterium, Alfa-proteobacteria y Gammaproteobacteria son más abundantes en las capas superficiales. Gamma-proteobacteria también fue más abundante en la oxiclina profunda y Beta-proteobacteria es el grupo con las menores abundancias registradas. Se detectó a través de NMDS cambios en la distribución vertical de la comunidad del picoplancton en la columna de agua entre ZMO y la oxiclina. Este cambio fue producto de las transiciones de las abundancias de los grupos específicos Cytophaga-flavobacterium y Gamma-proteobacteria en las capas superficiales, producto de la baja concentración de clorofila-a causada por los períodos de relajación en la surgencia.

  • English

    Abstract: The bacterioplankton in the upwelling systems associated with oceanographic condition of the oxygen minimum zone (OMZ) of the Eastern tropical South Pacific was studied through visualization and enumeration with fluorescent in situ hybridization (FISH). Six different taxonomic groups were studied (Alpha, Beta, Gamma-proteobacteria, Cytophaga-flavobacterium and the domains Archaea and Bacteria). The analysis showed a greater predominance of the Bacteria domain (20 to 68% of hybridized cells) over Archaea (2 to 18% of hybridized cells). The specific groups showed that Cytophaga-flavobacterium, Alpha-proteobacteria and Gamma-proteobacteria are more abundant in the surface layer. Gamma-proteobacteria is also most abundant in the deep oxycline and, Beta-proteobacteria is the group with the lowest registered abundances. Changes in the vertical distribution of the bacterial community in the water column between OMZ and on oxycline were observed through NMDS. This change is a product of a shift in the abundances of the specific groups Cytophaga-flavobacterium and Gamma-proteobacteria in the surface layers, due to low concentration of chlorophyll-a caused by periods of relaxation in the upwelling.