Bioseguridad en laboratorios de diagnóstico molecular de SARS-CoV-2 (COVID-19) mediante RT-qPCR

• Hernández-Rangel, Rosa I. ^[1] ; Navarro, Juan Carlos ^[2] ; Arias, Yurianni E. ^[3] ; Ramírez-Iglesias, José R. ^[2] ; Herrera, Leidi ^[4] ; Fernández-Baca, Martha V. ^[1]
  1. [1] Instituto de Medicina Tropical Alexander Von Humboldt, Sede Cusco. Universidad Peruana Cayetano Heredia. Cusco-Perú.
  2. [2] Centro de Biodiversidad y Enfermedades Emergentes, Fac Ciencias Naturales y Ambientales. Universidad Internacional SEK. Quito-Ecuador.
  3. [3] Laboratorio de Aislamiento Viral. Instituto Nacional de Higiene. Caracas-Venezuela.
  4. [4] Facultad de Ciencias. Instituto de Zoología y Ecología Tropical. Universidad Central de Venezuela. Caracas-Venezuela.

  Mostrar afiliaciones +
• Localización: CienciAmérica: Revista de divulgación científica de la Universidad Tecnológica Indoamérica, ISSN-e 1390-9592, Vol. 9, Nº. Extra 2, 2020 (Ejemplar dedicado a: ESPECIAL “Desafíos Humanos ante el COVID-19”), págs. 207-226
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Biossegurança em laboratórios de diagnóstico molecular para SARS-CoV-2 (COVID-19) usando RT-qPCR
  • Biosafety in molecular diagnostic laboratories for SARS-CoV-2 (COVID-19) using RT-qPCR
• Enlaces
  • Texto completo (pdf)
• Resumen
  • español

    La pandemia del síndrome respiratorio agudo conocido como COVID-19 y causada por el virus SARS-CoV-2, ha obligado a diversos laboratorios alrededor del mundo a rediseñar y reforzar sus programas de bioseguridad con la finalidad de facilitar el diagnóstico de la enfermedad y colaborar con datos epidemiológicos para la toma de decisiones asociadas a mitigación y control. Una combinación de buenas prácticas de laboratorio y procedimientos claramente definidos, apoyados en la adecuación de la infraestructura, son necesarios para proteger al personal de laboratorio y asegurar la reproducibilidad de los resultados generados. En esta revisión se muestran los lineamientos de bioseguridad fundamentales a implementar en los laboratorios de diagnóstico de la COVID-19, basados en RT-qPCR. El establecimiento del nivel de seguridad biológica a adoptar, así como de los procedimientos operativos estándar, dependerán de la evaluación de riesgo derivada de las actividades intrínsecas del laboratorio. Hasta la fecha, la OMS ha recomendado un nivel 2 de seguridad biológica NBS-2 (BSL-2), con medidas intensificadas de nivel 3 NBS-3 (BSL-3), para actividades de diagnóstico, con prácticas y equipos de protección personal que minimicen la generación de aerosoles y reduzcan la probabilidad de infecciones adquiridas en laboratorio. De igual forma, se ha hecho énfasis en un flujo de trabajo que tome en cuenta el transporte de la muestra bajo reglamentos internacionales y procedimientos para la inactivación del virus, compatibles con la prueba diagnóstica o con los protocolos para la descontaminación de superficies. A pesar del reto que conlleva la adecuación de programas de mitigación ante un patógeno relativamente desconocido como el SARS-CoV-2, es importante destacar que la cultura de bioseguridad permite reducir los riesgos del personal y del medio ambiente y asegurar la calidad de los resultados generados, que permitan contribuir significativamente a lograr el control de la enfermedad.

  • English

    The pandemic of the acute respiratory syndrome known as COVID-19 and caused by the SARS-CoV-2 virus, has forced various laboratories around the world to redesign and strengthen their biosafety programs in order to facilitate the diagnosis of the disease and collaborate with epidemiological data for decision-making associated with mitigation and control. A combination of good laboratory practices and clearly defined procedures, supported by the adequacy of the infrastructure, are necessary to protect laboratory personnel and ensure the reproducibility of the results generated. This review shows the fundamental biosafety guidelines to be implemented in the COVID-19 diagnostic laboratories, based on RT-qPCR. The establishment of the level of biological safety to be adopted, as well as the standard operating procedures, will depend on the risk assessment derived from the intrinsic activities of the laboratory. To date, the WHO has recommended a level 2 biological safety BSL2, with intensified level 3 measures BSL3, for diagnostic activities, with practices and personal protective equipment that minimize the generation of aerosols and reduce the probability of laboratory-acquired infections. Likewise, emphasis has been placed on a workflow that takes into account the transport of the sample under international regulations and procedures for the inactivation of the virus, compatible with the diagnostic test or with protocols for surface decontamination. Despite the challenge of adapting mitigation programs against a relatively unknown pathogen such as SARS-CoV-2, it is important to highlight that the biosafety culture reduces the risks of personnel and the environment and ensures the quality of the results. generated, which make it possible to contribute significantly to achieving disease control.

  • português

    A pandemia da síndrome respiratória aguda conhecida como COVID-19 e causada pelo vírus SARS-CoV-2, forçou vários laboratórios ao redor do mundo a redesenhar e fortalecer seus programas de biossegurança, a fim de facilitar o diagnóstico da doença e colaborar com a epidemiologia. dados para tomada de decisão associados à mitigação e controle. É necessária uma combinação de boas práticas de laboratório e procedimentos claramente definidos, apoiados pela adequação da infraestrutura, para proteger o pessoal do laboratório e garantir a reprodutibilidade dos resultados gerados. Esta revisão mostra as diretrizes fundamentais de biossegurança a serem implementadas nos laboratórios de diagnóstico COVID-19, com base no RT-qPCR. O estabelecimento do nível de segurança biológica a ser adotado, bem como dos procedimentos operacionais padrão, dependerá da avaliação de risco derivada das atividades intrínsecas do laboratório. Até o momento, a OMS recomendou uma BSL2 de segurança biológica de nível 2, com medidas intensificadas de BSL3 de nível 3, para atividades de diagnóstico, com práticas e equipamentos de proteção individual que minimizem a geração de aerossóis e reduzam a probabilidade de infecções adquiridas em laboratório. Da mesma forma, a ênfase foi colocada em um fluxo de trabalho que leva em consideração o transporte da amostra de acordo com os regulamentos e procedimentos internacionais para a inativação do vírus, compatível com o teste de diagnóstico ou com os protocolos de descontaminação da superfície. Apesar do desafio de adaptar os programas de mitigação a um patógeno relativamente desconhecido, como o SARS-CoV-2, é importante destacar que a cultura de biossegurança reduz os riscos do pessoal e do meio ambiente e garante a qualidade dos resultados. gerados, o que possibilita contribuir significativamente para o controle da doença.