La variabilidad genética del Circovirus Porcino 2 (PCV-2) en un escenario de infección natural revela una compleja red de cuasiespecies virales

• Autores: Ana Mª Florencia Correa Fiz, Giovanni Franco, Anna Llorens, Joaquim Segalés Coma, Tuija Kekarainen
• Localización: Suis, ISSN 1699-7867, Nº. 173, 2020, págs. 26-29
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Porcine circovirus 2 (PCV-2) genetic variability under natural infection scenario reveals a complex network of viral quasispecies
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• Resumen
  • español

    El circovirus porcino 2 (PCV-2) se caracteriza por una alta tasa de evolución que promueve la posible aparición de diferentes genotipos y cepas. Este estudio tenía como objetivo analizar la variabilidad genética de las subpoblaciones (o cuasiespecies) de.PCV-2. Se realizó un muestreo semanal longitudinal en animales individuales en tres granjas diferentes desde la primera vez que se detectara la infección por este virus. El análisis de los polimorfismos evaluados a lo largo de todo el genoma demostró la presencia de varios polimorfismos de un solo nucleótido (SNP), especialmente en la región del genoma que codifica el gen de la cápside. La reconstrucción global del haplotipo in silico permitió inferir la red de transmisión del virus en el tiempo, lo que sugiere una circulación relevante dentro de la granja. Se encontraron evidencias de coinfección y recombinación que implicaban múltiples genotipos de PCV-2 después de mezclarse con cerdos procedentes de diferentes orígenes.

    El estudio demuestra la notable variabilidad genética dentro del huésped de las cuasiespecies de PCV-2, lo que sugiere el papel de la selección natural inducida por la respuesta inmunitaria del huésped en la conducción de la evolución de PCV-2. Además, se demostró que el manejo los cerdos incide en la aparición de coinfecciones múltiples y la probabilidad de recombinación de genotipos.

  • English

    Porcine circovirus 2 (PCV-2) is a virus characterized by a high evolutionary rate, promoting the potential emergence of different genotypes and strains. This study aimed to analyze the within-host genetic variability of PCV-2 subpopulations to unravel the forces driving PCV-2 evolution. A longitudinal weekly sampling was conducted on individual animals located in three farms after the first PCV-2 detection. The analysis of polymorphisms evaluated throughout the full PCV-2 genome demonstrated the presence of several single nucleotide polymorphisms (SNPs) especially in the genome region encoding for the capsid gene. The global haplotype reconstruction allowed inferring the virus transmission network over time, suggesting a relevant within-farm circulation. Evidences of co-infection and recombination involving multiple PCV-2 genotypes were found alter mixing with pigs originating from other sources. The present study demonstrates the remarkable within-host genetic variability of PCV-2 quasispecies, suggesting the role of the natural selection induced by the host immune response in driving PCV-2 evolution. Moreove1, the effect of pig management in multiple genotype coinfections occurrence and recombination likelihood was demonstrated.