Filogeografía de glmM en cepas de Helicobacter pylori aisladas de pacientes con patologías gástricas al sur de México

• Ferman-Orduña, Alan Michelle ^[1] ; Torres-Ramos, Rogelio Gabriel ^[1] ; Román-Román, Adolfo ^[1] ; Forero-Forero, Angela Victoria ^[2] ; Ruvalcaba Ledezma, Jesús Carlos ^[3] ; Toribio-Jiménez, Jeiry ^[1]
  1. [1] Universidad Autónoma de Guerrero

     Universidad Autónoma de Guerrero

     México

     
  2. [2] Universidad Nacional Autónoma de México

     Universidad Nacional Autónoma de México

     México

     
  3. [3] Departamento de Medicina y Coordinación de la Maestría en Salud Pública en [ICSa-UAEH] Instituto de Ciencias de la Salud-Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo, Pachuca hidalgo, México.

  Mostrar afiliaciones +
• Localización: Journal of Negative and No Positive Results: JONNPR, ISSN-e 2529-850X, Vol. 5, Nº. 11 (Noviembre 2020) JONNPR 2020;5(11):1262-1463), 2020, págs. 1367-1377
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Phylogeography of glmM in Helicobacter pylori strains isolated from patients with gastric pathologies in southern Mexico
• Enlaces
  • Texto completo (pdf)
• Resumen
  • español

    Introducción. Helicobacter pylori posee un genoma de aproximadamente 1600 genes, el gen glmM está  altamente conservado y se ha utilizado para identificar H. pylori por su sensibilidad y especificidad en  biopsias gástricas. La diversidad genética de H. pylori es alta entre cepas del mismo origen geográfico y es  aún más a escala global. En México, son pocos los estudios que destacan la importancia de la variabilidad  genética de esta bacteria, la cual es estudiada mediante técnicas moleculares.

    Objetivo. Analizar la variabilidad genética del gen glmM en cepas de H pylori de pacientes con patologías  gástricas.

    Metodología. Se analizaron solo 90 secuencias del gen glmM (10 de grupo de estudio y 80 depositadas en el  GenBank), posteriormente realizamos redes de haplotipos, donde se puede observar las diferencias en pasos utacionales de las secuencias a nivel estatal y con otros grupos geográficos con el fin de hacer una  reconstrucción de filogenia basada en las relaciones ancestro-descendiente.

    Resultados. Las cepas analizadas provenían el 30% hombres y 70% mujeres, con una edad promedio de 42  años, con diagnóstico de gastritis, las secuencias de glmM mostraron variabilidad genética. De las secuencias analizadas, se propone confirmar la presencia de ocho haplotipos que se agrupan separados.

    Conclusiones: Se sugiere hacer estudios detallados a nivel molecular de los haplotipos del gen glmM en  cepas de H. pylori para conocer su distribución geográfica con la finalidad de conocer las cepas circulantes a  nivel mundial y con esto evitar los resultados negativos.

     

  • English

    Introduction: Helicobacter pylori has a genome of approximately 1600 genes, the glmM gene is highly  conserved and has been identified to identify H. pylori due to its sensitivity and specificity in gastric biopsies.  The genetic diversity of H. pylori is high among strains of the same geographical origin and is even more of a  global scale. In Mexico, studies that study the importance of the genetic variability of this bacterium, which is  studied by molecular techniques.

    Aim. To analyze the genetic variability of the glmM genus in H pylori strains of patients with gastric  pathologies.

    Methodology. Only 90 sequences of the glmM genus were analyzed (10 of study group and 80 deposit in  GenBank), to carry out haplotype networks, where the differences in the steps of the relationships at the  state level and with other geographical groups can be observed in order to do a reconstruction of phylogeny  based on ancestor-descendant relationships.

    Results. The strains analyzed showed 30% of men and 70% of women, with an average age of 42 years,  diagnosed with gastritis, the glmM sequences. From the sequences analyzed, it is proposed to confirm the  presence of eight haplotypes that are grouped separately.

    Conclusions. We suggest university studies at the molecular level of the glmM haplotypes in strains of H.  pylori to know their geographical distribution in order to know the circulating strains worldwide and with this avoid negative results.