El circovirus porcino tipo 2 (PCV2) es un patógeno de propagación mundial controlado con protocolos de vacunación generalmente muy eficaces. Con el fin de comparar los perfiles de detección de PCV2 en granjas con diferentes estados de vacunación, se probaron con PCR cuantitativa en tiempo real suero (359), heces (351) y fluidos orales (209) de cuatro granjas que no vacunan contra PCV2 (Non Vac) y de 22 granjas que sí vacunan (Vac). Además, se obtuvieron secuencias de nucleótidos de ORF2 del virus a partir de muestras seleccionadas. Se detectaron tres genotipos, PCV2a, PCV2b y PCV2d. Las diferencias en la prevalencia y las cantidades de PCV2 entre las granjas Vac y Non Vac fueron significativas. En cinco granjas Vac, no se detectó viremia ni excreción en las heces. Por otro lado, en cuatro granjas Vac, los resultados fueron muy similares a los de las granjas Non Vac. No se observaron diferencias significativas en la prevalencia de PCV2 en líquidos orales entre granjas Vac y Non Vac. Se puede recomendar un examen de la viremia para detectar problemas de eficacia de la vacunación. La mediana de las cargas virales de PCV2>6,0 log10 copias/ml en los sueros combinados de la población vacunada debe considerarse una indicación muy clara de que es necesario revisar el protocolo de vacunación.
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