Genetic diversity and population structure of the Chilean native, Tillandsia landbeckii (Bromeliaceae), from the Atacama Desert

• Elizabeth Bastías ^[1] ; Edith Choque-Ayaviri ^[1] ; Joel Flores ^[2] ; Glenda Fuentes-Arce ^[3] ; Patricio López-Sepúlveda ^[3] ; Wilson Huanca-Mamani ^[1]
  1. [1] Universidad de Tarapacá

     Universidad de Tarapacá

     Arica, Chile

     
  2. [2] Universidad Nacional Agraria La Molina

     Universidad Nacional Agraria La Molina

     Perú

     
  3. [3] Universidad de Concepción

     Universidad de Concepción

     Comuna de Concepción, Chile

     

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• Localización: Revista Mexicana de Biodiversidad, ISSN 1870-3453, ISSN-e 2007-8706, Vol. 91, Nº. 2, 2020
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Diversidad genética y estructura poblacional de Tillandsia landbeckii (Bromeliaceae), nativa chilena del desierto de Atacama
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    Tillandsia landbeckii Phil. es una planta típica del desierto de Atacama en el norte de Chile. No hay datos genéticos disponibles a nivel de población para esta especie y esta información es crítica para desarrollar e implementar medidas de conservación efectivas. En este estudio, investigamos por primera vez la diversidad genética y la estructura poblacional en 2 poblaciones naturales de T. landbeckii mediante marcadores del tipo AFLP. Siete combinaciones de primers produjeron 405 bandas, de las cuales, 188 (46.42%) fueron polimórficas. La población de Pampa Dos Cruces (Pp = 88.30%, He = 0.327 y I = 0.483) mostró un nivel de diversidad genética mayor que la población de Pampa Camarones (Pp = 71.28%, He = 0.253 y I = 0.380). El análisis de la varianza molecular (Amova) reveló que el 25.12% de la diversidad genética total residía entre las poblaciones, mientras que el 74.88% está dentro de las poblaciones. Se observó un coeficiente de diferenciación genética de moderado a alto (Fst = 0.251) y un moderado flujo genético en la población (Nm = 1.490). Los análisis de coordenadas principales (PCoA), neighbor-net y STRUCTURE soportaron la agrupación de las poblaciones muestreadas en 2 grupos genéticos moderados. Este primer estudio proporciona datos que permitirán asistir y apoyar decisiones de conservación que se tomen para esta especie.

  • English

    Tillandsia landbeckii Phil. is a typical plant of the Atacama Desert in the north of Chile. There is no genetic data available at the population level for this species, and this information is critical for developing and implementing effective conservation measures. In this study, we investigated for the first time the genetic diversity and population structure in 2 natural populations of T. landbeckii using AFLP markers. Seven primer combinations produced 405 bands and of them, 188 (46.42%) were polymorphic. The Pampa Dos Cruces population (Pp = 88.30%, He = 0.327, and I = 0.483) showed a higher genetic diversity level than Pampa Camarones population (Pp = 71.28%, He = 0.253, and I = 0.380). Analysis of molecular variance (Amova) revealed that 25.12% of the total genetic diversity resided among populations, while 74.88% within populations. A moderate-high genetic differentiation coefficient (Fst = 0.251) and a moderate population gene flow (Nm = 1.490) were also observed. Principal coordinates analysis (PCoA), Neighbor-net and STRUCTURE analysis supported the grouping of the sampled populations into 2 moderate genetic clusters. This first study provides data that will allow assist and support conservation decisions taken for this species.