La limitación en el número de materias activas con uso autorizado en la post-cosecha de cítricos, ha provocado un uso reiterado de las mismas. Esto, unido a las características propias del manipulado de los cítricos dentro de un almacén de confección, con almacenajes, conservaciones, retratamientos, etc. ha facilitado la aparición de cepas de hongos resistentes a algunos de los fungicidas usados, y un peligro potencial de futuras resistencias si no se proyectan variaciones en las estrategias adoptadas hasta la fecha.
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