Resumen de Epidemiología genómica del virus SARS-CoV-2 con una plataforma bioinformática
Sebastian A. Iglesias Osores, Percy Omar Tullume Vergara, Johana Acosta Quiroz, Johnny L. Saavedra Camacho, Arturo Rafael Heredia
Introducción: las epidemias virales han demostrado ser un riesgo para la salud humana, ya que pueden convertirse en pandemias y afectar a gran parte de la población, especialmente a los países pobres en vías de desarrollo. En este año 2020 la pandemia mundial por la COVID-19 está en marcha. Actualmente se están llevando a cabo investigaciones que muestran datos que combinan tanto la información genética como la social, las cuales pueden cambiar nuestra comprensión acerca de la dinámica de la epidemia.
Objetivo: describir la herramienta tecnológica basada en la ciencia de datos, denominada Nextstrain, que permite visualizar las epidemias con los datos más actualizados en tiempo real, utilizando las bases de datos académicas.
Desarrollo: actualmente hay secuencias virales de 57 países en 6 continentes. El antepasado común del virus que circula en el mundo surgió en Wuhan (China), a finales de 2019, y desde donde se supone que ha mutado hacia los seres humanos a partir de murciélagos y pangolines. En lo que respecta al seguimiento, se han realizado trabajos de investigación con este instrumento en países como Taiwán, Francia y Finlandia, que han podido determinar el lugar de origen de las cepas del SARS-CoV-2 que causan los brotes en sus respectivos países. Nextstrain permite compartir libremente los análisis filogenéticos de varios autores de diferentes países, así como analizar el amplio trabajo realizado sobre la epidemiología del virus.
Conclusiones: Nextstrain es una herramienta creada a partir de grandes bases de datos que brinda una mejor visión acerca de patógenos de interés para la epidemiología mundial. Su uso se apoya en herramientas bioinformáticas y muestra esta información a través de un entorno agradable y comprensible.
