Diversidad genética de una colección de yuca a través de marcadores moleculares RAPDS

• Asia Y. Zambrano ^[1] ; J.R. Demey ^[2] ; Francia Fuenmayor ^[1] ; Víctor Segovia ^[1] ; Zulay Gutiérrez ^[1]
  1. [1] Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias. Investigador
  2. [2] TI-GC- Consutor
• Localización: Agronomía Tropical, ISSN 0002-192X, Vol. 53, Nº. 2, 2003
• Idioma: español
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• Resumen
  • español

    Con el objetivo de conocer la diversidad genética del Banco de Germoplasma de Yuca, Manihot esculenta Crantz, del Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias, INIA- Venezuela, se estudiaron los productos de amplificación de 65 entradas utilizando los iniciadores aleatorios OPA-04, OPA-07, OPB-07, OPK-03, OPK-05, OPK-15, OPM-04, OPM- 14, OPM- 18 y OPM-20. Para identificar el agrupamiento natural de los clones, las matrices de similitud o disimilitud obtenidas utilizando los coeficientes de Jaccard, Emparejamiento Simple, Dice y Rogers y Tanimoto fueron representadas gráficamente utilizando dos métodos de agrupamiento, el generado por árboles jerárquicos, bajo tres métodos de encadenamiento: simple, completo y promedio, y el generado por árboles no-jerárquicos utilizando como método de agregación el Neighbor-Joining ponderado. Los resultados obtenidos permiten seleccionar al OPB-07 como el iniciador que ofrece mayor nivel de resolución en la caracterización de los clones de la colección, la estructura generada con este iniciador garantiza la menor distorsión entre las disimilaridades iniciales y las que resultan del árbol no-jerárquico, cuantificada a través del coeficiente de correlación cofenética y el índice de diversidad de Shannon.

  • English

    In order to study the genetic diversity of cassava collections of the CENIAP-INIA (Maracay, Venezuela) PCR products from 65 entrances were studied using the RAPD primers: OPA-04, OPA-07, OPB-07, OPK-03, OPK-05, OPK- 1 5, OPM-04, OPM- 14, OPM- 1 8 y OPM-20. With the patterns generated by primers, using similarities or dissimilarities between entrances, calculated according to Jaccard, Simple Matching, Dice and Rogers and Tanimoto coefficients, hierarchical and non- hierarchical trees aggregated according to Neighbor-Joining procedure were represented graphically in order to identify the best natural group. Results showed that best primer is OPB-07 in order to study genetic diversity with a high level of resolution. The structure generated with this primer reduces distortion between initial dissimilarities and those that are due to non-hierarchical tree measurements through the cophenetic correlation and Shannon's diversity index .