Whole Sequencing of the Mitochondrial Genome of Breast Cancer Tissue in Mexican-Mestizo Postmenopausal Women with Different Body Mass Index

• Nishi Adam Reyes ^[1] ; Ramón M. Coral Vázquez ^[2] ; Juan P. Méndez ^[2] ; Alberto Tenorio ; Juan Carlos Zenteno ; Vanessa Villegas Ruiz ^[3] ; Patricia Canto ^[2]
  1. [1] Universidad Nacional Autónoma de México

     Universidad Nacional Autónoma de México

     México

     
  2. [2] Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán

     Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán

     México

     
  3. [3] Instituto de Oftalmología Aplicada de Valladolid

     Instituto de Oftalmología Aplicada de Valladolid

     Valladolid, España

     

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• Localización: Revista de investigación clínica, ISSN 0034-8376, ISSN-e 2564-8896, Vol. 71, Nº. 4, 2019, págs. 237-245
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • La secuenciación del genoma mitocondrial del tejido de cáncer de mama en México-mestizo posmenopáusica Mujeres con diferente genoma indexrial de masa corporal de tejido de cáncer de seno en mujeres posmenopáusicas mexicano-mestizas con diferente índice de masa corporal
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• Resumen
  • español

    Antecedentes: el estrés mitocondrial y oxidativo se ha relacionado con la obesidad y el cáncer de mama, siendo este cáncer más frecuente y más agresivo en mujeres posmenopáusicas con obesidad.

    Objetivo: El objetivo de este estudio fue investigar si las mujeres posmenopáusicas mexicano-mestizas con cáncer de mama y obesidad presentan diferentes mutaciones somáticas en el ADN mitocondrial (ADNmt) en comparación con las mujeres con índice de masa corporal (IMC) normal.

    Sujetos y métodos: Se incluyeron seis mujeres posmenopáusicas mexicano-mestizas portadoras de cáncer de seno y que se sometieron a una mastectomía o cirugía conservadora de seno. El IMC se determinó en cada caso. El ADN genómico de los pacientes se aisló de leucocitos de sangre y muestras de tejido tumoral. La secuencia completa de ADNmt se determinó mediante la matriz de resecuenciación mitocondrial MitoChip v2.0, y los datos se analizaron usando el software de análisis de secuencia GeneChip. La secuencia de ADNmt tumoral se comparó con la secuencia de ADNmt leucocitaria coincidente.

    Resultados: Tres mujeres tenían un IMC normal y tres presentaron obesidad. En general, encontramos 64 variantes genéticas: 53.1% fueron mutaciones somáticas y 46.9% fueron polimorfismos; 44.1% estaban en la región no codificante y 55.9% estaban en genes que codifican proteínas mitocondriales. Entre las mutaciones somáticas, el 67.7% estaba en pacientes con IMC normal y el 32.3% en pacientes con obesidad.

    Conclusiones: No encontramos una mayor frecuencia de mutaciones somáticas mitocondriales en mujeres posmenopáusicas con cáncer de mama y obesidad en comparación con aquellas con IMC normal. Sin embargo, los resultados podrían deberse al pequeño número de mujeres estudiadas.

  • English

    Background: Mitochondrial and oxidative stress has been related to obesity and breast cancer being this cancer more frequent and more aggressive in postmenopausal women with obesity. Objective: The objective of this study was to investigate whether Mexican-Mestizo postmenopausal women with breast cancer and obesity present different somatic mutations in the mitochondrial DNA (mtDNA) when compared to women with normal body mass index (BMI). Subjects and Methods: We included six Mexican-Mestizo postmenopausal women bearing breast cancer and who underwent mastectomy or breast-conserving surgery. BMI was determined in each case. Patients’ genomic DNA was isolated from blood leukocytes and tumor tissue samples.

    Whole mtDNA sequence was determined by MitoChip v2.0 mitochondrial resequencing array, and data were analyzed using the GeneChip Sequence Analysis Software. Tumor mtDNA sequence was compared with matched leukocyte mtDNA sequence.

    Results: Three women had a normal BMI and three presented obesity. Overall, we found 64 genetic variants: 53.1% were somatic mutations and 46.9% were polymorphisms; 44.1% were in the non-coding region and 55.9% were in genes that encode for mitochondrial proteins. Among the somatic mutations, 67.7% were in patients with normal BMI and 32.3% in patients with obesity. Conclusions: We did not find a higher frequency of mitochondrial somatic mutations in postmenopausal women with breast cancer and obesity compared to those with normal BMI. However, results could be due to the small number of women studied.

    (REV INVEST CLIN. 2019;71:237-45)