Optimización de técnicas de extracción de ADN y amplificación de marcadores QTL en trucha arco iris (Oncorhynchus mykiss)

• Bibiana Rogel ^[1] ; Valeria Marcucci ^[1] ; Pedro De Carli ^[1]
  1. [1] Universidad Nacional de la Patagonia Austral (Argentina)
• Localización: Informe Científico Técnico UNPA, ISSN-e 1852-4516, Vol. 11, Nº. 2, 2019, págs. 128-135
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Optimization of DNA extraction and amplification techniques of QTL markers in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
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  • español

    La trucha arco iris (Oncorhynchus mykiss) es un salmónido resistente, de crecimiento rápido, y tolerante a una amplia gama de ambientes y manipulaciones, lo que le otorga un gran potencial para la acuicultura.

    Actualmente, la producción de trucha arcoiris representa aproximadamente el 30% de la producción acuícola de Argentina, que durante el 2015 tuvo una producción de 3.900 t. La producción es absorbida por el mercado local y también se la exporta a Estados Unidos de América. La trucha de cultivo patagónica tiene gran valor debido a que se produce en condiciones seguras de inocuidad sanitaria y sin uso de antibióticos. El cultivo en la provincia de Santa Cruz se realiza en sistemas intensivos en estanques en tierra o extensivos mediante la siembra en lagos y lagunas. En el año 1992, la Estación Municipal de Piscicultura Isla Pavón (EMPIP) se constituye como el primer y único centro de producción de trucha arco iris en la provincia de Santa Cruz. Desarrolla un programa de mejoramiento genético realizando cruzamientos sucesivos y dirigidos, de individuos con alta tasa de crecimiento y buen filete. La productividad y sostenibilidad de la piscicultura se ve favorecida por la posibilidad de producir organismos de mejor calidad en un menor tiempo.

    El uso de marcadores moleculares para selección en generaciones tempranas constituye una herramienta que permite identificar los genotipos, y de esta manera reforzar la selección basada en características fenotípicas. Su aplicación permite seleccionar los reproductores con mayor potencial productivo a través de la identificación de alelos de interés económico (QTL).

    En relación a la identificación de QTLs en trucha arcoiris, diversos autores han trabajado con marcadores de ADN nuclear para distintas características de interés productivo, entre ellas, resistencia a enfermedades, tasa de crecimiento, maduración sexual, producción de ovas, entre otras.

    En el presente estudio se optimizaron técnicas de extracción de ADN a partir de tejido, se evaluaron distintos marcadores QTL descritos en la bibliografía y se optimizaron técnicas de amplificación para un marcador seleccionado. El análisis realizado representa una de las herramientas que permitirá a la EMPIP conocer el estado del stock de reproductores mediante su caracterización genotípica.

  • English

    Rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) is a resistant salmonid, that growing fast and tolerant of a wide range of environments and manipulations, which gives it great potential for aquaculture. Currently, in Argentina, production of rainbow trout represents about 30% of aquaculture production, which in 2015 had a production of 3,900 t. Production is absorbed by the local market and also exported to United States. The trout cultivate in patagonia is great value because it occurs under health safety conditions, without antibiotics. Cultivation in Santa Cruz is done in intensive (pools) or extensive system by seeding in lakes and ponds. In 1992, the Municipal Cultivate Fish Station Isla Pavón (EMPIP) becomes in the first and only center that produce rainbow trout in the province of Santa Cruz. Develops a breeding program performing successive and crossbreeding of individuals with high growth rate and good fillet. Productivity and sustainability of fish farming is favored by the hability to produce better quality organisms in less time.

    Using molecular markers for selection in early generations is a tool to identify genotypes, and thus reinforce the selection based on phenotypic characteristics. Its application allows players to select the most productive potential through the identification of alleles economic interest (Quantitative trait loci); in this way it favored the development of particular genotypes with subsequent improvement of recurrent selection populations.

    The analysis represents one of the tools that allow the EMPIP at a later instance, the status of broodstock and phenotypically characterize the entire population to be used as parents in generating subsidiaries subject to selection.

    Regarding the identification of QTLs in rainbow trout,several authors have worked with nuclear DNA markers for different characteristics of productive interest, including disease resistance, growth rate, sexual maturation, egg production, among others.So far, there are no history of QTL identification markers of STR type for O. mykiss in Argentina.

    The aim of the present study was to optimize DNA extraction techniques from tissue, to evaluate different QTL markers described in the literature and to optimize amplification techniques for selected markers,as well as to perform an assessment of QTL determination techniques of the type STR.