La consanguinité génétique au sein des races suisses de moutons et de chèvres

• Heidi Signer-Hasler ^[2] ; Alexander Burren ^[2] ; Philippe Ammann ^[3] ; Cord Drögemüller ^[1] ; Christine Flury ^[2]
  1. [1] University of Bern

     University of Bern

     Bern/Berne/Berna, Suiza

     
  2. [2] Haute école des sciences agronomiques, forestières et alimentaires HAFL. Zollikofen. Suisse
  3. [3] ProSpecieRara. Bâle. Suisse

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• Localización: Recherche agronomique suisse, ISSN 1663-7917, Vol. 10, Nº. 10, 2019, págs. 372-379
• Idioma: varios idiomas
• Títulos paralelos:
  • Extent of genomic inbreeding in Swiss sheep and goat breeds
  • Consanguineità genomica nelle razze ovine e caprine svizzere
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  • italiano

    Lo sviluppo delle moderne tecnologie permette oggigiorno, tramite la genotipizzazione del DNA, di individuare migliaia marcatori genetici nel patrimonio genetico di un animale. Questa informazione può essere utilizzata per derivare la consanguineità genomica, che è molto utile per le popolazioni il cui pedigree è assente o incompleto. Inoltre, possono essere evidenziate differenze nella consanguineità tra fratelli pieni e può essere accertato dove la consanguineità abbia influenzato il patrimonio genetico. La consanguineità fornisce in tal modo indicazioni sulla diversità genetica all’interno di una razza. Nel presente studio è stata ricavata la consanguineità genomica di 1120 pecore appartenenti a undici razze e di 332 capre di dieci razze. Per gli animali esaminati appartenenti alle razze caprine Saanen (SA), Toggenburgo (TO), Striata grigionese (BS), Capre vallesane (WZ), Appenzello (AP) e Sangallese dagli stivali (ST), così come per le razze ovine Naso nero del Vallese (SN), Pecora dagli specchi (SPS), Roux du Valais (WLS) e Nana d’Ouessant (OUE) è risultata una consanguineità genomica media superiore al 6,25%. In generale, la presa in considerazione dei dati genomici permette una migliore comprensione dei gradi di parentela e delle relazioni di consanguineità nelle razze svizzere e in tal modo rende possibili scelte più consapevoli nell’allevamento e in eventuali attività di conservazione delle razze.

  • Multiple

    Grâce aux technologies modernes de génotypage de l’ADN, il est aujourd’hui possible de révéler des variations spécifiques (marqueurs) à plusieurs milliers d’endroits du génome d’un animal. Ces informations peuvent être utilisées pour déterminer la consanguinité génomique au sein d’une population. Elles sont donc très précieuses lorsque les données généalogiques sont lacunaires ou inexistantes. Elles permettent aussi de faire ressortir des différences de consanguinité entre pleins frères et sœurs et de révéler quelles régions du génome sont affectées. Bref, elles renseignent sur la diversité génétique qui prévaut au sein d’une race. La présente étude de consanguinité génomique a porté sur 1120 moutons de 11 races et 332 chèvres de 10 races. Une consanguinité génétique moyenne de plus de 6,25% a été observée entre les individus étudiés des races caprines Gessenay (SA), Toggenbourg (TO), Grisonne à raies (BS), Chèvres du Valais (WZ), Appenzell (AP) et Bottée (ST), ainsi que des races ovines Nez noir du Valais (SN), Mouton miroir (SPS), Roux du Valais (WLS) et Ouessant (OUE). De manière générale, le recours aux données génomiques améliore notre compréhension des rapports de parenté et de la consanguinité au sein des races suisses, ce qui permet de prendre des décisions plus nuancées en matière d’élevage ou d’éventuelles mesures de conservation.

  • English

    The development of modern technologies now allows thousands of genetic markers in an animal’s genome to be revealed by means of DNA genotyping. This information can be used to deduce genomic inbreeding. This is valuable for populations that have no, or only incomplete, pedigree information. Furthermore, differences in the inbreeding of full siblings can be demonstrated and it is possible to identify where in the genome the inbreeding has had an effect. In this way it provides clues to genetic diversity within a breed. In this study, genomic inbreeding was investigated for 1,120 sheep from eleven breeds and for 332 goats from ten breeds. An average genomic inbreeding >6.25% between individual animals was observed in the goat breeds Saanen (SA), Toggenburg (TO), Grisons Striped (BS), Valais goat (WZ), Appenzell (AP) and Stiefelgeiss (ST), as well as for the sheep breeds Valais Blacknose (SN), Spiegel (SPS), Roux du Valais (WLS) and Ouessant (OUE). In general, the consideration of genomic data allows a better understanding of kinship and inbreeding conditions in Swiss breeds and therefore enables better decision-making in relation to breeding and possible conservation activities.