Nuevos iniciadores matK para código de barras de la vida en especies del género Dasylirion

• Martha Monzerrath Orozco-Sifuentes ^[1] ; Dulce Victoria Mendoza-Rodríguez ^[1] ; Fernando Hernández-Godinez ^[2] ; Octavio Martínez ^[2] ; José Ángel Villarreal-Quintanilla ^[1] ; M.Humberto Reyes-Valdés ^[1]
  1. [1] Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro

     Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro

     México

     
  2. [2] Instituto Politécnico Nacional

     Instituto Politécnico Nacional

     México

     
• Localización: Revista mexicana de ciencias agrícolas, ISSN 2007-0934, ISSN-e 2007-9230, Vol. 10, Nº. 6, 2019, págs. 1313-1324
• Idioma: varios idiomas
• Títulos paralelos:
  • New matK initiators for life barcode in species of the genus Dasylirion
• Enlaces
  • Texto completo (pdf)
• Resumen
  • English

    Dasylirion species are among the most important in the Chihuahuan Desert in ecological and economic terms. Its main use is the elaboration of a traditional alcoholic beverage called sotol. The genus comprises 22 species, not all suitable for this purpose and their identification is difficult. Molecular tools such as the barcode of life facilitate their identification and generate genetic information. There are universal primers for the matKgene, whose sequence is appropriate for life's barcode, which do not work for some species of this genus. The difference of a single nucleotide can cause problems in amplification. The objective of this work was to design and test new initiating sequences of the matKgene, which allow amplification in plants of the genus Dasylirion.The Primer3 Plus, FastPCR and the complete sequence of the matKgene of D. wheeleriwere used for the design. The new oligonucleotides were tested with the species D. texanum, D. leiophyllum, D. occidentalisand D. palaciosii, with clean amplification of the matKgene (approximately 1000 bp fragment) in each of them. These results contrasted with those obtained from the universal primers matK390F and matK1 326R, which generated secondary bands or failed amplification. Since the new initiators successfully amplified the matKgene in the studied species of Dasylirion,they are considered of value as tools for obtaining the barcode of life in sotol. Researchconducted during the years 2016 to 2018.

  • Multiple

    Las especies de Dasylirion se encuentran dentro de las más importantes del desierto chihuahuense en términos ecológicos y económicos. Su uso principal es la elaboración de una bebida alcohólica tradicional llamada sotol. El género comprende 22 especies, no todas aptas para este fin y su identificación es difícil. Herramientas moleculares como el código de barras de la vida facilitan su identificación y generan información genética. Hay iniciadores universales para el gen matK, cuya secuencia es apropiada para código de barras de la vida, que no funcionan para algunas especies de este género. La diferencia de un solo nucleótido puede generar problemas en la amplificación. El objetivo de este trabajo fue diseñar y probar nuevas secuencias iniciadoras del gen matK, que permitan amplificación en las plantas del género Dasylirion. Para el diseño se utilizaron los programas Primer3 Plus, FastPCR y la secuencia completa del gen matK de D. wheeleri. Los nuevos oligonucleótidos fueron probados con las especies D. texanum, D. leiophyllum, D. occidentalis y D. palaciosii, con amplificación limpia del gen matK (fragmento aproximado 1 000 pb) en cada una de ellas. Estos resultados contrastaron con los obtenidos a partir de los iniciadores universales matK 390F y matK 1 326R, que generaron bandas secundarias o fallaron en la amplificación. Ya que los nuevos iniciadores amplificaron exitosamente el gen matK en las especies estudiadas de Dasylirion, se consideran de valor para como herramientas para la obtención de código de barras de la vida en sotol. Investigación realizada durante los años 2016 a 2018.